轻松构建系统发育树
￥ 32 6.4折 ￥ 50 九五品
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作者[美] 霍尔 著,陈士超,傅承新,吴晓运,BARRY,G.
出版社高等教育
ISBN9787040439489
出版时间2016-02
版次1
装帧平装
开本16开
纸张胶版纸
页数264页
定价50元
上书时间2024-03-25
商品详情
- 品相描述：九五品
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基本信息
书名:轻松构建系统发育树
定价：50元
作者:[美] 霍尔 著,陈士超,傅承新,吴晓运,BARRY,G. ..
出版社：高等教育
出版日期：2016-02-01
ISBN：9787040439489
字数：
页码：264
版次：1
装帧：平装
开本：16开
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内容提要
系统发育分析是基因组学和生物信息学等新兴领 域的核心内容。尽管生物信息学发展更为迅猛，但系 统发育分析仍然被认为是其中较难理解的部分。霍尔著的《轻松构建系统发育树》是一本非常实用的书， 会帮助读者快速学习如何构建系统发育树。即使您不 能全部理解本书中“学习更多”知识框中的内容，也 可以完成任务。当你能娴熟地构建系统树之后，就容 易理解这些附加的解释和理论背景知识，并有技巧 地加以运用。 本书适合生物信息学、进化生物学、基因组学等 相关学科的青年学子作为入门教材阅读，也可供相关 学科的科研人员与教师参考。
目录
章 前言全新升级的软件什么是系统发育树?构建系统发育树：基本介绍扩展内容学习更多的原理关于附录Ⅲ计算程序简述以及如何获得它们如何感谢软件作者《轻松构建系统发育树》配套网站第2章 构建系统发育树为什么要构建系统发育树?关于这个教程搜索与你的目标序列相关的序列判断哪些相关序列可用于你的系统发育树分析下载序列比对序列构建一个邻接(NJ)树总结第3章 获取序列搜寻同源序列：什么样的序列可以用于构建一个系统树?进一步熟悉BLAST搜索使用BLAST的核苷酸检索页面使用BLAST搜索相关的蛋白质序列建树的最终序列选择用其他方式寻找感兴趣的序列(注意!风险较高)第4章 序列联配用MUSCLE软件联配序列检查和手工调整联配结果检查平均一致度来估测联配结果的可信度通过调整MUSCLE参数设置提升联配速度用ClustalW联配序列第5章 构建系统发育树的主要方法距离法和基于性状的方法你应该用哪一种方法?第6章 邻接树使用MEGA5构建邻接树无根和有根树估测系统树的可靠性如何处理蛋白质序列?第7章 绘制系统发育树改变系统树的外观为系统树置根保存系统树说明第8章 简约法MP搜索方法多个同等简约树最后的分析第9章 似然法用MEGA进行似然法分析用自展法估计ML树的可靠性如果是蛋白质序列会怎么样?0章 用MrBayes程序构建贝叶斯树MrBayes概述用MrBayes估算树的一个通用策略创建执行文件如何运行你的MrBayes分析?更复杂(更有用)的“mrbayesblocks”当MrBayes运行时的屏幕输出如果你不能获取聚合是什么原因?蛋白质序列如何处理?可视化贝叶斯树使用FigrFree软件1章 使用不同的计算机平台命令行程序Macintosh平台上运行MEGA软件行结束符问题安装命令行程序命令行程序的运行环境获得和安装MrBayes运行公用程序2章 使用GUIDANCE进行高级联配联配可靠性问题GUIDANCE是如何工作的用SmallData数据集阐述的例子GUIDANCE的应用3章 重建祖先序列用MEGA的似然法重建祖先序列构建的祖先序列有多准确?4章 检测适应性进化联配准确性对于检测适应性进化的影响使用MEGA检测适应性进化用codeml检测适应性进化总结5章 系统发育网络为什么仅用系统树并不足够有根和无根的系统发育网络用splitsTree估算无根的系统发育网络用Dendroscope软件从有根树构建有根网络6章 最后的建议：学习编程附录Ⅰ 文件格式及其相互转换格式描述转换格式附录Ⅱ 其他程序附录Ⅲ 常见问题参考文献
作者介绍
序言
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【封面】
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