生物信息学分析实践

图书标准信息

• 作者 吴祖建、高芳銮、沈建国 编
• 出版社 科学出版社
• 出版时间 2010-06
• 版次 1
• ISBN 9787030278319
• 定价 30.00元
• 装帧 平装
• 开本 16开
• 纸张 胶版纸
• 页数 222页
• 字数 349千字
• 正文语种 简体中文
• 丛书 科学版研究生教材

【内容简介】

　　《生物信息学分析实践》主要内容包括生物信息学简介，三大数据库检索，引物设计及测序结果分析，核酸序列分析，氨基酸序列分析，蛋白质空间结构预测，系统发育分析，RNA分析，参考文献管理。每章均提供进一步阅读指南和有关网址。

【目录】

序
前言

第一章生物信息学简介
1.1生物信息学基础
1.1.1什么是生物信息学
1.1.2生物信息学的形成与发展
1.1.3生物信息学的研究内容
1.2生物信息学应用
1.2.1生物信息学的热点领域
1.2.2信息技术与生物信息学

第二章数据库检索
2.1综合性数据库NCBI
2.1.1NCBI简介
2.1.2NCBI数据库介绍
2.1.3Entrez简介
2.1.4Entrez检索实例
2.2综合性数据库EMBL_EBI
2.2.1EBI简介
2.2.2EBI数据库简介
2.2.3SRS简介
2.2.4SRS检索实例
2.2.5BioMart简介
2.2.6BioMart检索实例
2.3UCSC基因组浏览器
2.3.1UCSC基因组浏览器简介
2.3.2UCSC基因组浏览器检索实例

第三章引物设计及测序结果分析
3.1引物设计
3.1.1概述
3.1.2常规PCR引物设计实例分析
3.1.3简并引物设计
3.2测序结果分析
3.3序列拼接实例分析

第四章核酸序列分析
4.1常规分析
4.1.1核酸序列的检索
4.1.2核酸序列组分分析
4.1.3序列变换
4.1.4限制性酶切分析
4.2比对分析
4.2.1BLAST比对
4.2.2双序列比对
4.2.3多序列比对
4.3基因结构识别
4.3.10RF识别及其可靠性验证
4.3.2启动子及转录因子结合位点分析
4.3.3重复序列分析
4.3.4CpGisland
4.3.53'UTR区

第五章蛋白质序列分析
5.1蛋白质序列的基本性质分析
5.1.1理化性质分析
5.1.2疏水性分析
5.1.3跨膜区分析
5.1.4信号肽预测
5.1.5Coil区分析
5.1.6亚细胞定位
5.2结构域分析及motif搜索
5.2.1结构域分析
5.2.2motif搜索
5.3空间结构预测
5.3.1蛋白质二级结构预测
……

第六章分子进化与系统发育分析
第七章RNA分析
主要参考文献及网址
附录
彩图