【全新正版】 基因组大数据分析(高等学校数据科学与大数据技术专业系列教材)
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作者编者:袁细国|责编:武伟婵//雷鸿俊
出版社西安电子科大
ISBN9787560658605
出版时间2020-08
装帧其他
开本其他
定价24元
货号30970578
上书时间2024-06-29
商品详情
- 品相描述：全新
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目录
第一章 基因组大数据概述
1.1 基因组大数据相关概念及发展历史简介
1.2 基因组大数据介绍
1.3 测序技术的发展
1.3.1 第一代测序技术
1.3.2 第二代测序技术
1.3.3 第三代测序技术
1.4 基因数据格式
1.4.1 FASTA
1.4.2 FASTQ
本章习题
第二章 生物信息数据的处理
2.1 真实数据与仿真数据
2.1.1 人类基因组参考序列
2.1.2 真实数据的获取
2.1.3 仿真数据
2.2 处理测序数据的基本工具
2.2.1 FastQC
2.2.2 Trimmomatic
2.2.3 BWA
2.2.4 Samtools
2.3 数据处理实例演示
2.3.1 数据处理实例流程
2.3.2 数据处理过程中产生的文件格式
本章习题
第三章 拷贝数变异(CNV)检测的基本原理与方法
3.1 CNV相关概念
3.2 CNV检测分类
3.3 CNV检测基本原理
3.3.1 配对末端图谱法
3.3.2 分裂读段法
3.3.3 读段深度法
3.3.4 从头组装法
3.4 CNV实验仿真
3.4.1 典型的仿真方法
3.4.2 仿真实验与具体操作步骤
本章习题
第四章 单位点变异检测
4.1 单位点变异的基本概念
4.2 单位点变异的分类
4.2.1 单核苷酸多态性
4.2.2 单核苷酸变异
4.2.3 SNP和SNV的区别
4.2.4 SNV研究的现状
4.2.5 SNV研究的意义
4.3 经典SNV检测方法简介
4.3.1 STIC基本介绍
4.3.2 SomaticSniper基本介绍
4.4 SNV实验仿真
4.4.1 数据仿真介绍
内容摘要
本书主要介绍基因组大数据分析与处理的相关技术。书中循序渐进地介绍了相关生物信息学软件的下载和安装方式，提供了真实数据和仿真数据的获取或生成方式；针对拷贝数变异、单位点变异、结构变异以及微生
物物种鉴定等问题，全面介绍了相关处理过程及基本原
理，并结合典型算法说明了数据处理的基本流程。
本书最大的特色在于提供了丰富的算法实例，每一
个实例都是经过精心挑选的，具有很强的针对性，力求
使读者尽可能快地掌握基因组大数据分析与处理的全过程。
本书适合作为计算机和大数据类相关专业高年级本科生与研究生的教材，对从事计算生物学研究的技术人员也有很好的参考价值。
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