常用生物数据分析软件

图书标准信息

• 作者 王俊 著
• 出版社 科学出版社
• 出版时间 2008-05
• 版次 1
• ISBN 9787030206220
• 定价 65.00元
• 装帧 平装
• 开本 16开
• 纸张 胶版纸
• 页数 364页
• 字数 99999千字
• 正文语种 简体中文

【内容简介】

　　本书较为系统全面地介绍了生物信息学分析各个方面的软件用法，结合光盘具体实例，方便使用。全书共分8章，内容包括：Unix/Linux操作系统介绍，介绍了基本的Unix/Linux操作命令；数据的基本处理，介绍了如何处理常用的生物信息学数据；序列的比对，介绍了常用比对软件的用法及其在应用过程中要注意的问题；基因组/基因的注释，介绍了Coding和Non-Codoing基因的预测方法；SNP分析，介绍了常用的从生物学数据中寻找SNP的软件；进化分析专题，介绍了几种分子进化分析软件，内容涉及进化树的构建、Ka/Ks的计算等；基因表达分析专题，介绍了EST及生物芯片分析的流程和方法；蛋白质结构预测，介绍了蛋白质三维结构预测的流程及方法。
　　本书适合于生物信息学专业本科生及研究生使用。

【目录】

序
前言
第1章Unix/Linux操作系统介绍
1.1远程登录
1.2文件的复制、删除和移动命令
1.3目录的创建、删除及更改目录命令
1.4文本查看命令
1.5文本处理命令
1.6改变文件或目录的权限命令
1.7备份与压缩命令
1.8磁盘及系统管理
1.9软件安装简介
1.10其他
第2章数据的基本处理
2.1数据常用格式介绍
2.2测序原理介绍
2.3華图转化（Phred）
2.4文件转换（phd2fasta）
2.5载体屏蔽（cross_match）
2.6序列聚类拼接
2.7Consed
2.8引物设计（Primer3）
主要参考文献
第3章序列的比对
3.1全局比对
3.2局部比对
主要参考文献
第4章基因组/基因的注释
4.1重复序列分析
4.2RNA分析
4.3基因预测
4.4基因功能注释
主要参考文献
第5章SNP分析
5.1Polyphred
5.2SNPdetector
5.3cross_match
主要参考文献
第6章进化分析专题
6.1Phylip
6.2Paml
6.3KaKs_Calculator
6.4FGF
6.5MEGA
主要参考文献
第7章基因表达分析专题
7.1EST表达序列标签分析
7.2生物芯片分析
7.3Motif预测
主要参考文献
第8章蛋白质结构预测
8.1蛋白质结构知识介绍
8.2蛋白质结构预测方法
8.3蛋白质结构预测的Threading方法
8.4蛋白质三维结构预测流程介绍
主要参考文献