DNA编码序列的设计与优化

图书标准信息

• 作者 王延峰、崔光照 著
• 出版社 电子工业出版社
• 出版时间 2013-09
• 版次 1
• ISBN 9787121213243
• 定价 38.00元
• 装帧 平装
• 开本 16开
• 纸张 其他
• 页数 208页
• 字数 333千字
• 正文语种 简体中文

【内容简介】

　　《DNA编码序列的设计与优化》全面系统地介绍了DNA编码理论的基本内容及DNA编码序列的各种设计方法，集中涵盖了作者近年来在该领域内的研究成果。全书共14章，在较系统地介绍了DNA计算产生的背景、意义、基本思想、与DNA计算相关的分子生物学基础、DNA编码问题的定义和DNA编码的分子生物学约束及其相关研究进展的基础上，提出了一种基于统计学原理的、无须实验就可确定各评价指标的权重系数的方法——组合权重法，并据此建立了一套DNA编码系统评价模型。同时，详细探讨了启发式算法（如Hopfield神经网络算法、模拟退火遗传算法、文化遗传算法、非支配排序遗传算法、蚁群算法、粒子群优化算法、人工鱼群算法、野草算法）和搜索算法（如剪枝算法、随机产生实时过滤算法）等在DNA编码序列设计中的应用研究。

【目录】

第1章NDA计算
1.1DNA计算的出现
1.2DNA计算的研究进展
1.3DNA计算的实现方式
1.4DNA计算的基本思想
1.5DNA计算研究所面临的问题

第2章与DNA计算相关的分子生物学基础
2.1DNA的理化性质
2.1.1DNA的化学组成
2.1.2DNA的结构及特点
2.1.3DNA的变性与复性
2.2DNA杂交反应的热力学基础
2.2.1基本的热力学参数
2.2.2G0与H0、S0和温度的关系
2.2.3浓度对G的影响
2.2.4G，H，S和Keq的温度依赖性

第3章DNA计算中的编码问题
3.1DNA计算中的编码问题
3.1.1DNA编码问题的定义
3.1.2DNA编码的非规范几何结构
3.1.3规范几何结构的数学模型
3.2DNA编码的分子生物学约束
3.2.1物理约束
3.2.2热力学约束
3.3DNA编码问题的研究现状

第4章基于随机产生实时过滤算法的DNA编码序列设计
4.1设计思想
4.2DNA编码序列设计
4.2.1（I）类约束条件
4.2.2（I）类约束条件的排序
4.2.3（II）类约束条件
4.3结果与讨论

第5章基于组合权重的DNA编码序列集合评价模型
5.1系统评价
5.1.1系统评价的定义及步骤
5.1.2评价指标体系
5.1.3权重
5.2DNA编码评价指标的建立
5.3DNA编码序列集合评价模型
5.3.1基于组合权重的综合评价模型
5.3.2约束条件之间的相关性
5.3.3权重系数的确定方法
5.4结果与讨论

第6章基于改进Hopfield网络算法的DNA编码序列设计
6.1MNCP是NP困难问题
6.1.1图的最大团问题
6.1.2MNCP可映射为MCP
6.2Hopfield网络
6.2.1离散型Hopfield网络
6.2.2连续型Hopfield网络
6.2.3Hopfield网络与优化计算
6.3DNA编码序列设计
6.3.1神经元内电位更新模式的改进
6.3.2基于改进Hopfield网络算法的MCP求解
6.3.3算法实现
6.4结果与讨论

第7章基于模拟退火遗传算法的DNA编码序列设计
7.1模拟退火遗传算法
7.1.1模拟退火算法
7.1.2遗传算法
7.1.3模拟退火算法与遗传算法的混合策略
7.2DNA编码序列设计
7.2.1问题描述
7.2.2算法实现
7.3结果与讨论

第8章基于文化遗传算法的DNA编码序列设计
8.1文化算法
8.1.1文化算法的计算框架
8.1.2文化算法的理论介绍
8.1.3文化算法的实现步骤
8.2DNA编码序列设计
8.2.1问题描述
8.2.2算法实现
8.3结果与讨论

第9章基于改进NSGA-II的DNA编码序列设计
9.1非支配排序遗传算法
9.1.1多目标优化问题的定义及相关概念
9.1.2非支配排序遗传算法
9.1.3带精英策略的非支配排序遗传算法
9.2DNA编码序列设计
9.2.1数学模型
9.2.2约束条件的处理
9.2.3算法实现
9.3结果与讨论

第10章基于混合蚁群算法的DNA编码序列设计
10.1蚁群算法
10.1.1蚁群算法的基本原理
10.1.2蚁群算法的逻辑结构
10.1.3蚁群算法的模型
10.1.4蚁群算法的实现步骤
10.2DNA编码序列设计
10.2.1构造城市群
10.2.2蚂蚁的转移规则
10.2.3路径评价
10.2.4交叉和变异操作
10.2.5算法实现
10.3结果与讨论

第11章基于剪枝优化算法的DNA编码序列设计
11.1搜索算法与剪枝优化
11.1.1搜索方法
11.1.2剪枝优化
11.2DNA编码序列设计
11.3结果与讨论

第12章基于粒子群优化算法的DNA编码序列设计
12.1粒子群优化算法
12.1.1标准粒子群优化算法
12.1.2粒子群优化算法的改进策略
12.1.3常用的测试函数
12.2DNA编码序列设计
12.2.1设计思想
12.2.2约束条件的选择
12.2.3适应度函数的建立
12.2.4算法实现
12.2.5结果与讨论
12.3基于四进制离散粒子群优化算法的DNA编码序列设计
12.3.1二进制粒子群优化模型
12.3.2四进制粒子群优化模型
12.3.3问题描述
12.3.4算法实现
12.3.5结果与讨论

第13章基于改进人工鱼群算法的DNA编码序列设计
13.1人工鱼群算法
13.1.1人工鱼群算法的基本原理
13.1.2人工鱼群的行为描述
13.1.3人工鱼群算法的数学模型
13.1.4人工鱼群算法描述
13.1.5人工鱼群算法的寻优机制分析
13.2DNA编码序列设计
13.2.1数学模型
13.2.2改进的人工鱼群算法
13.2.3算法实现
13.3结果与讨论

第14章基于野草算法的DNA编码序列设计
14.1野草算法
14.1.1野草特性
14.1.2野草算法
14.1.3野草算法的收敛性分析
14.1.4野草算法的相关研究
14.2基于野草算法的DNA编码序列设计
14.2.1数学模型
14.2.2算法实现
14.3结果与讨论
参考文献