DNA芯片和基因表达：从实验到数据分析和模建（影印版）

图书标准信息

• 作者 [美]P.鲍尔迪（Pierre Baldi）、[美]G.W.哈特菲尔德（G.Wesley Hatfield） 著
• 出版社 科学出版社
• 出版时间 2003-10
• 版次 1
• ISBN 9787030122483
• 定价 29.00元
• 装帧 平装
• 开本 其他
• 纸张 其他
• 页数 228页
• 正文语种 英语

【内容简介】

《DNA芯片和基因表达：从实验到数据分析与模建（影印版）》在生物学和医药前沿领域中，基因组测序、高通量药物筛选、DNA芯片（微阵）等技术应用越来越广泛。使用给定细胞中的mRNA，在给定的时间及条件下，DNA芯片能够快速检测出该细胞中的基因表达水平，可以研究基础的生物学现象（如进化、发育）、判断新基因的功能、检测药物反应及其他基因表达组成等。《DNA芯片和基因表达：从实验到数据分析与模建（影印版）》是涉及多学科领域的DNA芯片导论，对于生物学工作者及有志于使用这一技术的计算机科学研究人员是必备的参考读物。内容包括基因组学简介、DNA芯片格式及阅读方法、基因表达实验、芯片数据统计分析、当前DNA芯片应用等，行文严谨，内容全面，具有较高的参考价值。

【目录】

Preface
1Abriefhistoryofgnomics

2DNAarrayformats
Insitusynthesizedoligonucleotidearrays
Pre-synthesizedDNAarrays
Filter-basedDNAarrays
Non-conventionalgeneexpressionprofilingtechnologies

3DNAarrayteadoutmethods
Readingdatafromafluorescentsignal
Readingdatafromaradioactivesignal

4Geneexpressionprofilingexperiments:problems,pitfalls,andsolutions
Primarysourcesofexperimentalandbiologicalvarization
Specialconsiderationsforgeneexpressionprofilinginbacteria
ProblemsassociatedwithtargetpreparationwithpolyadenylatedmRNAfromeukaryoticcells
AtotalRNAsolutionfortargertpreparationfromeukaryoticcells
TargetcDNAsolutionfortargetpreparationfromeukaryoticcells
Dataacquisitionfornylonfilterexperiments
DataacquisitionforAffymetrixGeneChipTMglassslideexperiments
Normalizationmethods

5Statisticalanalysisofarraydata:Ingerringchanges
Problemsandcommonapproaches
Probablilisticmodelingofarraydata
Simulations
Extensions

6Statisticalanalysisofarraydata:Dimensionalityreduction,clustering,andregulatoryregions
Problemsandapproaches
Visualization,dimensionalityreduction,andprincipalcomponentanalysis
Clusteringoverview
Hierarchicalclustering
K-means,mixturemodels,andEMalgorithms
DNAarraysandregulatoryregions

7Thedesign,analysis,andinterpretationofgeneexpressionprofilingexperiments
Experimentaldesign
Identificationofdifferentiallyexpressedgenes
DeterminationofthesourceoferrorsinDNAarrayexperiments
EstimationoftheglobalfalsepositivelevelforaDNAarrayexperiment
ImprovedstatisticalinferencefromDNAarraydatausingaBayseianstatisticalframework
Nylonfilterdatavs.AffymetrixGeneChipTMdata
ModelingprobepairsetdatafromAffymetrixGeneChipsTM
Applicationofclusteringandvisualizationmethods
Identificationofdefferentialgeneexpressionpatternsresultingformtwo-variableperturbationexperiments

8Systemsbiology
Introduction
Themolecularworle:RepresentationandSimulation
Computationalmodelsofregulatorynetworks
Softwareanddatabases
Thesearchforgeneralprinciples
AppendixAExperimentalprotocols
AppendixBMathematicalcomplements
AppendixCInternetresoutces
AppendixDCyberT:AnonlineprogramforthestatisticalanalysisofDNAarraydata
Index