常用计算机辅助药物设计软件教程
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全新
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作者张亮仁 主编
出版社中国医药科技出版社
ISBN9787506792158
出版时间2017-04
版次1
装帧平装
开本16开
纸张胶版纸
页数257页
字数257千字
定价42元
货号SC:9787506792158
上书时间2024-12-23
商品详情
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- 商品描述
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内容简介:
计算机辅助药物设计已成为一门新兴的研究领域,在合理药物设计中发挥不可或缺的作用。张亮仁编著的《常用计算机辅助药物设计软件教程》依据实际工作中各种软件的应用,介绍了分子动力学模拟、分子对接、蛋白质同源模建、定量构效关系的研究、药效团的构建、虚拟筛选等内容,且每一内容有不止一个软件的使用介绍,适合入门计算机辅助药物设计的广大师生参考使用。
目录:
第一章同源模建法预测蛋白质结构
第一节同源模建概述
第二节同源模建
第二章分子对接预测结合位点
第一节利用AutoDock进行分子对接
第二节利用D0CK进行分子对接
第三节利用Surflex-Dock进行分子对接
第四节利用GOLD进行分子对接
第三章蛋白质与核酸的分子动力学模拟
第一节分子动力学概述
第二节利用GROMACS进行纯蛋白分子动力学模拟
第三节蛋白与小分子复合物的动力学模拟
第四节核酸分子动力学模拟
第四章利用OpenEye组件包进行虚拟筛选
第一节软件简介
第二节利用OpenEye组件包进行虚拟筛选
第五章定量构效关系分析
第一节CoMFA&CoMSIA
第二节HQsAR
第六章药效团
第一节药效团介绍
第二节利用Discovery Studio进行药效团模型构建
第七章全新药物设计
第一节概述
第二节利用LigBuilder进行全新药物设计
第八章作图软件PyMOL的应用
第一节PyMOL简介
第二节PyMOL基本操作
第九章药物设计实例
第一节利用OpenEye发现F.tularensis烯酰基载体蛋白还原酶FabI抑制剂
第二节基于模建结构的虚拟筛选发现对虾黄头病毒蛋白酶抑制剂
第三节基于药效团建模和分子对接的虚拟筛选发现β-分泌酶抑制剂
参考文献
彩图
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