植物基因组学

图书标准信息

• 作者 樊龙江
• 出版社 科学出版社
• 出版时间 2020-04
• 版次 31
• ISBN 9787030633132
• 定价 108.00元
• 装帧 其他
• 开本 128开
• 纸张 胶版纸
• 页数 468页
• 字数 750千字

【内容简介】

本教材分为总论和各论两篇，分别包括15章和10章。总论系统介绍了植物基因组学的基础理论和方法，包括植物基因组测序拼接、转录修饰、进化选择、育种利用，以及植物单细胞基因组、三维基因组和合成基因组等前沿研究，同时兼顾植物群体基因组和细胞器基因组等主题。总论提供了植物基因组的总体概貌和共性知识。各论着重介绍了代表性植物物种（如模式植物、重要农作物和进化起源相关植物）的基因组。各论展现了植物基因组的多样性和异质性。

【目录】

篇 论

-1章 绪论002

节 基因组及基因组学概念 002

一、基因组基本概念 002

二、基因组学及其技术概述 004

三、基因组学发展简史 006

第二节 植物基因组测序历史与特征 011

一、植物基因组测序历史及其进展 011

二、植物基因组特征 013

第三节 植物基因组学展望 015

一、植物基因组学研究路线图 015

二、植物基因组学面临的挑战与展望 016

-2章 植物基因组测序与拼装 018

节 基因组概貌调查 018

一、细胞遗传学分析 018

二、基因组调查测序与k-mer分析 020

第二节 植物基因组测序 023

一、目前主要测序技术 023

二、植物基因组测序策略 025

第三节 植物基因组拼接组装 026

一、基因组拼接 026

二、染体水组装 029

-3章 植物基因组构成 032

节 植物基因组大小与基本结构 032

一、植物基因组大小 032

二、植物基因组基本结构 034

第二节 植物基因组主要构成因子 035

一、蛋白质编码基因 035

二、非编码基因 043

三、重复序列 051

-4章 植物基因组转录 054

节 植物基因组转录概述 054

一、转录组及其测定 054

二、基因转录水分析 056

三、植物基因组转录调控 057

第二节 植物基因组转录特征 058

一、植物转录本构成及其数量 058

二、蛋白质编码基因转录水与特征 059

三、发育和环境胁迫下编码基因转录变化 062

四、发育和环境胁迫下非编码基因转录变化 065

-5章 植物基因组表观遗传修饰 068

节 植物基因组甲基化 068

一、dna甲基化及其测定 068

二、植物发育与胁迫过程dna甲基化变化 073

第二节 植物基因组印记 075

一、基因组印记概述 075

二、植物基因组印记研究举例 079

-6章 植物基因组进化 083

节 植物基因组起源与复制 083

一、植物基因组起源与进化 083

二、基因组复制 088

第二节 基因组突变、重组与转座 089

一、dna突变与修复 089

二、同源重组 091

三、转座 096

第三节 基因组多倍化 098

一、基因组片段倍增 098

二、基因组多倍化方式 102

三、基因组多倍化后二倍化过程 105

第四节 其他基因组进化机制 107

一、横向基因转移 107

二、b染体 110

-7章 植物群体基因组 113

节 群体基因组学概述 113

一、群体基因组变异检测 113

二、群体基因组进化分析方法 114

三、基因组选择信号检测方法 116

四、泛基因组分析 118

第二节 自然群体基因组特征与自然选择 119

一、自然群体基因组变异 119

二、群体起源和进化历史 121

三、自然选择位点及其特征 123

第三节 作物群体基因组特征与人工选择 125

一、人工选择对作物基因组的影响 125

二、作物群体结构 131

三、作物基因组人工选择位点 133

四、遗传渐渗与环境适应 136

五、作物泛基因组 136

-8章 植物单细胞基因组 139

节 单细胞基因组学概述 139

一、单细胞及其基因组研究历史 139

二、单细胞基因组学关键技术 141

第二节 植物单细胞基因组研究 147

一、植物单细胞基因组研究案例 147

二、植物单细胞基因组学展望 149

-9章 植物三维基因组 152

节 三维（3d）基因组学概述 152

一、三维基因组及其分析技术 152

二、三维基因组学应用领域 156

第二节 植物三维基因组研究 162

一、基于三维构象的植物基因组组装 162

二、植物基因组三维构象与调控元件特征 163

-10章 植物合成基因组 166

节 合成生物学概述 166

一、合成生物学概念及其技术 166

二、植物合成基因组意义与展望 171

第二节 植物基因组设计与合成 172

一、植物次生代谢途径人工合成 173

二、光合途径与高光效植物创制 175

三、植物底盘基因组 178

-11章 叶绿体基因组 180

节 叶绿体基因组概述 180

一、叶绿体及其基因组测序进展 180

二、叶绿体基因组结构与转录 183

第二节 叶绿体基因组特征与利用 187

一、叶绿体基因组进化缓慢 187

二、叶绿体基因组横向转移 187

三、叶绿体基因组利用 189

-12章 植物线粒体基因组 192

节 植物线粒体基因组概述 192

一、植物线粒体及其基因组测序进展 192

二、植物线粒体基因组结构 193

第二节 植物线粒体基因组特征与利用 197

一、线粒体基因组大小跨度大 197

二、动植物线粒体基因组存在明显差异 199

三、rna编辑 202

四、植物线粒体基因组利用 203

-13章 植物功能基因组学 205

节 功能基因定位与关联 205

一、数量状基因座定位 205

二、全基因组关联分析 207

三、混池分离分析 209

第二节 突变体创制与分析 211

一、理化诱变 212

二、插入突变 214

第三节 基因功能分析技术 216

一、基因编辑 216

二、rna干扰 223

三、植物表型组学技术 225

-14章 组学数据育种利用 229

节 组学数据与作物育种 229

一、作物育种过程及其遗传本质 229

二、作物组学数据育种利用途径 231

第二节 作物育种选择的基因组学解析 237

一、遗传重组率图谱 238

二、作物遗传传递及其变异 239

三、优势 243

第三节 组学相关育种技术 247

一、基因组选择 247

二、大数据技术及其育种利用 249

-15章 植物基因组数据资源 255

节 综合基因组数据资源 255

一、国际公共基因组数据库 255

二、植物综合基因组数据库 256

第二节 植物转录与修饰相关数据资源 259

一、植物转录相关数据库 259

二、植物表观遗传修饰相关数据库 262

第二篇 各论

第2-1章 拟南芥基因组 266

节 拟南芥基因组概况 266

一、拟南芥及其系统发生关系 266

二、基因组测序历史与进展 267

三、基因组基本构成及其数据库 269

第二节 拟南芥基因组特征与进化 273

一、少有植物基因组倍增证据 273

二、植物模式基因组构成 274

三、植物自然群体基因组变异 276

第三节 拟南芥基因组转录与功能 277

一、拟南芥基因组转录与修饰 277

二、拟南芥功能基因及其基因组分布 280

第2-2章 水稻基因组 282

节 水稻基因组概况 282

一、稻属系统发生关系与基因组大小 282

二、基因组测序历史与进展 285

三、基因组基本构成及其数据库 288

第二节 水稻基因组特征与进化 292

一、古老多倍体 292

二、基因组提供籼稻与粳稻驯化起源的证据 293

三、栽培稻可能发生去驯化过程 295

第三节 水稻基因组转录与功能 297

一、基因组转录与修饰 297

二、重要农艺状功能基因位点 301

第2-3章 玉米基因组 304

节 玉米基因组概况 304

一、玉蜀黍属系统发生及其基因组测序进展 304

二、基因组基本构成及其数据库 309

第二节 玉米基因组进化与功能 311

一、基因组特征与进化 311

二、基因组转录与功能 315

第2-4章 小麦基因组 320

节 小麦基因组概况 320

一、小麦系统发生及其基因组测序情况 320

二、普通小麦基因组基本构成及其数据库 325

第二节 小麦基因组进化与功能 327

一、基因组特征与进化 327

二、基因组转录与功能 334

第2-5章 大豆基因组 342

节 大豆基因组概况 342

一、大豆系统发生及其基因组测序情况 342

二、基因组基本构成及其数据库 345

第二节 大豆基因组进化与功能 347

一、基因组特征与进化 347

二、基因组转录与功能 349

第2-6章 棉花基因组 355

节 棉花基因组概况 355

一、棉属系统发生及其基因组测序进展 355

二、棉花基因组基本构成及其数据库 358

第二节 棉花基因组进化与功能 359

一、基因组特征与进化 359

二、基因组转录与功能 362

第2-7章 油菜基因组 369

节 油菜基因组概况 369

一、油菜基因组大小及其测序进展 369

二、油菜基因组基本构成及其数据库 372

第二节 油菜基因组进化与功能 373

一、甘蓝型油菜基因组特征与进化 373

二、基因组转录与修饰 376

三、功能基因基因组关联分析 380

第2-8章 蔬菜基因组 385

节 蔬菜基因组概述 385

一、蔬菜主要种类及其基因组测序情况 385

二、蔬菜基因组特征与进化 389

第二节 蔬菜基因组功能与利用 393

一、番茄果实发育相关功能基因 393

二、蔬菜瓜果风味功能基因 394

第2-9章 林果花卉基因组 400

节 林果花卉基因组概述 400

一、主要林果花卉种类及基因组大小 400

二、林果花卉基因组测序概况 402

三、林果花卉基因组特征与进化 407

第二节 林果花卉基因组功能与利用 413

一、风味和营养形成相关功能基因 413

二、花卉观赏状相关基因 416

三、其他重要状基因位点鉴定 418

第2-10章 非维管束植物基因组 420

节 绿藻基因组 420

一、绿藻基因组概述 420

二、绿藻基因组特征及其进化 423

第二节 轮藻基因组 427

一、轮藻系统发生关系及其基因组 428

二、陆地植物遗产基因 429

第三节 苔藓类植物 434

一、苔类基因组 434

二、藓类基因组 438

主要参文献 444

附录1 植物基因组测序物种清单 446

附录2 主要中英文术语释义 456