E-mail访问网络生物医学资源实用指南

图书标准信息

• 作者 吕军 主编
• 出版社 上海科学技术出版社
• 出版时间 2002-09
• 版次 1
• ISBN 9787532365357
• 定价 15.00元
• 装帧 平装
• 开本 其他
• 纸张 胶版纸
• 页数 237页
• 字数 169千字

【内容简介】

本书是一本介绍如何通过E-mail获取Internet上医学和生物学信息资源的基本原理和方法的工具书。 包括的内容有：检索Medline--蛋白质、核酸与三维结构数据库；检索分析与人类基因组研究相关的一些重要的网络数据库，如序列的同源性、开放阅读框架(ORF)预测、蛋白质二级结构分析、RNA二级结构预测、分子模建等，这些都是生命科学最前沿的研究热点。现代科学研究的一个显著特点就是综合性大研究，学科之间交叉、联系日益紧密。本书介绍了如何通过Internet上邮件列表和新闻组这两种形式在世界范围内与同行或非同行交流、联系、协作、探讨；如何访问WWW上的医学生物学资源和WWW的各类检索引擎；如何访问FTP资源，寻找和下载有用的一些生物学档案资料；附录介绍一些使用E-mail技巧，使各章介绍的方法事半功倍。

  本书的主要读者对象为医学、药学和生命科学等领域的大学生、研究生、医务工作者、教师和研究人员。

【目录】

绪论

第一章  Medline——蛋白质、核酸与三维结构数据库检索

  第一节 简介

  第二节 Entrez可检索的数据库

  第三节 词条检索

    一 字段说明符

    二 字段解释

    三 布尔检索

    四 截词检索

    五 范围检索

  第四节 搜索参数选项

    一 显示方式选项

    二 其他选项

  第五节 替代符号

  第六节 流水号检索

    一 GenBank登录号与序列标识符

    二 用于UID中的Fasta格式

第二章  基因和基因组序列分析

  第一节 NCBI BLAST电子邮件服务器的介绍

    一 访问NCBI BLAST电子邮件服务器

    二 BLAST电子邮件检索请求示例

    三 NCBI BLAST电子邮件服务器检索的可选程序

    四 NCBI BLAST电子邮件服务器可用数据库

    五 NCBI BLAST电子邮件服务器指令表

    六 利用NCBI BLAST电子邮件服务器检索的序列格式

    七 序列标识符

    八 检索请求的呈递与等候

    九 向GenBank呈递新的数据或更新修订

  第二节 BLAST程序使用详解

    一 BLAST程序算法

    二 BLAST序列对比分值方案

    三 邻域

    四 HSP分值阈

    五 Karlin-Altschul统计学

    六 SUM统计学和Poisson统计学

    七 P值、比对分值及信息

    八 匹配报告中的选择度

    九 搜索敏感度

    十 遗传代码

    十一 设置参数

    十二 控制输出

    十三 环境变量

    十四 支持功能

    十五 输出示例与详解

    十六 原因不明的故障

  第三节 BLAST常见问题解答

    一 最常见的问题

    二 BLAST程序

    三 查询格式

    ……

第三章  访问医学与生物学邮件列表

第四章  访问医学与生物学新闻组

第五章  访问医学与生物学WWW资源

第六章  通过E-maill访问WWW的各类检索引擎

第七章  访问医学与生物学FTP资源

附录 一些实用的 E-mail技巧