蛋白质晶体结构解析原理与技术

图书标准信息

• 作者 苏纪勇、姚圆 著
• 出版社 北京大学出版社
• 出版时间 2020-09
• 版次 1
• ISBN 9787301315286
• 定价 56.00元
• 装帧 平装
• 开本 16开
• 纸张 胶版纸
• 页数 276页
• 字数 390千字

【内容简介】

  本书从实用的角度出发介绍了如何解析蛋白质晶体结构。全书分为6章，主要内容包括蛋白质结晶的方法、蛋白质晶体衍射数据收集、蛋白质晶体结构解析软件的安装和使用、蛋白质晶体结构文件提交到PDB的步骤及使用软件呈现蛋白质结构的方法。本书贴近实际操作，避开了各种深层次物理原理和数学知识，更多地讲解了软件操作流程与如何根据参数指标分析蛋白质晶体解析结果，易于具有生物科学背景的研究者理解；适用于蛋白质晶体结构研究领域的初学者和具备一定实验经验的研究者。

【作者简介】

  苏纪勇，东北师范大学生命科学学院副教授。德国图宾根大学生物学专业博士，德国马克斯普朗克遗传与发育研究所博士后。主要研究与糖类相互作用的蛋白质，包括半乳糖凝集素家族、C型凝集素、糖苷水解酶和糖苷转移酶等。

【目录】

第一章 蛋白质结晶前准备 

第一节 目的蛋白质信息检索与调查 

第二节 质粒制备 

第三节 蛋白质纯化 

第四节 蛋白质不表达和包涵体问题 

第五节 蛋白质活性鉴定 

第六节 蛋白质结晶前分析 

第二章 蛋白质结晶与衍射数据收集 

第一节 蛋白质结晶 

第二节 蛋白质晶体衍射数据收集 

第三章 蛋白质晶体结构解析软件安装 

第一节 Linux系统安装 

第二节 蛋白质晶体结构解析软件安装 

第四章 Index、integrate与scale 

第一节 一些晶体结构学知识 

第二节 蛋白质晶体结构解析流程 

第三节 Index和integrate 

第四节 Scale 

第五节 使用XSCALE功能进行scale 

第六节 使用HKL2000进行index、integrate和scale 

第五章 分子置换、构建优化与结构提交 

第一节 分子置换 

第二节 蛋白质晶体结构构建 

第三节 蛋白质晶体结构优化 

第四节 蛋白质晶体结构验证 

第五节 蛋白质晶体结构提交到PDB 

第六章 蛋白质晶体结构展示 

第一节 pdb格式文件简介 

第二节 PyMOL制作蛋白质晶体结构图 

第三节 使用PyMOL制作蛋白质配体结合位点的信息 

第四节 使用PyMOL调查蛋白质的温度因子B-factors 

第五节 使用PyMOL重叠对比不同的蛋白质晶体结构 

第六节 使用PyMOL显示蛋白质晶体结构中配体的电子密度图 

第七节 PyMOL结合Chimera实现同时显示非对称单元的蛋白质分子 

参考文献