生物信息学
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作者樊龙江 主编
出版社浙江大学出版社
ISBN9787308171472
出版时间2017-09
版次1
装帧平装
开本16开
纸张胶版纸
页数517页
字数830千字
定价98元
货号SC:9787308171472
上书时间2024-11-18
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商品详情
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作者简介:
樊龙江，浙江大学生物信息学研究所和作物科学研究所教授，生物信息学和作物遗传育种专业博士生导师。教育部“新世纪很好人才支持计划”获得者，浙江省生物信息学学会副理事长，德国DAAD访问学者。自2000年起，直接参与浙江大学生物信息学学科筹建，为浙江大学靠前批生物信息学专业导师。
内容简介:
本书建议阅读对象为本科、研究生、从事生物学及其相关专业领域（如医学、农学等）科研与开发人员等，可以作为生物信息学专业学生的入门教材和非生物信息学专业学生和科研工作者的基础教材。本书共分为四部分：生物信息学基础（靠前篇）、高通量测序数据分析（第二篇）、生物信息学外延与交叉（第三篇）和生物信息学资源与实践（第四篇）。各篇内容：（1）作为生物信息学的基础篇，靠前篇包括8章内容，涵盖序列数据产生、分子数据库、序列联配算法、基因预测、系统发生树构建和蛋白质结构预测等。同时也涵盖了生物信息学计算机基础部分，包括操作系统、主要编程语言等。该篇主要目的是使初学者掌握生物信息学的基本概念和主要方法；（2）第二篇为高通量序列数据分析篇，主要针对目前第二和三代测序技术产生的核苷酸序列数据的分析方法，主要涵盖基于高通量测序数据的基因组拼接、基因组变异、转录组、非编码RNA、甲基化和宏基因组等生物信息学分析原理和技术；（3）第三篇为生物信息学外延与交叉篇，分别介绍了与生物信息学紧密相关的四个生物学学科：系统生物学、群体遗传学、数量遗传学和合成生物学；（4）很后一篇生物信息学资源与实践篇，主要罗列了生物信息学主要相关术语、专业词汇、数据库和公开软件等资源，并提供了8个生物信息学实验课程内容。上述靠前和第四篇内容建议作为本科教学的基本内容，第二和三篇可以作为研究生和生物信息学专业学生教学内容。
目录:
绪论
第一节生物信息与生物信息学
一、迅速增长的生物信息
二、生物信息学的概念
第二节生物信息学简史与展望
一、生物信息学发展简史
二、生物信息学技术的应用
三、生物信息学学科展望
第三节本书的组织与使用
第一篇生物信息学基础
第1-1章生物信息类型及其产生途径
第一节生物信息的类型
第二节DNA测序技术
一、第一代测序技术
二、第二代测序技术
三、第三代测序技术
第三节高通量测序技术的应用
一、DNA／RNA相关测序
二、蛋白质-DNA／RNA互作测序
三、甲基化／宏基因组测序
第四节蛋白质序列及其结构测定
一、蛋白质序列与蛋白质互作测定
二、蛋白质结构测定
第1-2章分子数据库
第一节分子数据库概述
一、分子数据库概念
二、数据库记录格式
三、数据库冗余、序列递交和检索
第二节核苷酸及其相关数据库
一、DNA／RNA序列数据库
二、基因组数据库
三、非编码RNA数据库
第三节蛋白质及其相关数据库
第四节代谢途径等专业数据库
一、代谢途径数据库
二、代谢组学数据库和表型数据库
第1-3章两条序列联配算法及序列搜索
第一节序列联配基本概念
第二节计分矩阵
一、计分矩阵的一般原理
二、氨基酸替换矩阵
三、位置特异性计分矩阵（PSSM）
第三节两条序列联配算法
一、Needleman-Wunsch算法
二、Smith-Waterman算法
第四节BLAST算法及数据库搜索
一、BLAST算法
二、利用BLAS
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