• Python科学计算佳实践 SciPy指南
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Python科学计算佳实践 SciPy指南

33 4.8折 69 九五品

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作者[澳]胡安,努内兹,伊格莱西亚斯(JuanNunez-Igl

出版社人民邮电出版社

ISBN9787115499127

出版时间2019-01

版次1

装帧平装

开本16开

纸张胶版纸

页数206页

字数99999千字

定价69元

上书时间2024-03-27

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品相描述:九五品
商品描述
基本信息
书名:Python科学计算最佳实践 SciPy指南
定价:69.00元
作者:[澳]胡安,努内兹,伊格莱西亚斯(JuanNunez-Iglesias
出版社:人民邮电出版社
出版日期:2019-01-01
ISBN:9787115499127
字数:350000
页码:206
版次:1
装帧:平装
开本:16开
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编辑推荐
“本书结合信号处理、图像处理、网络科学、生物信息学等领域的例子,展示了如何通过Python优雅地实现经典的算法,是一本难得的科学计算教材。”——Lav Varshney,伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校“生动展示如何通过Python的科学计算工具达到事半功倍的效果。”——Greg Wilson,RStudio数据科学家,Software Carpentry联合创始人本书结合数据实例,使用SciPy及NumPy、pandas、scikit-image等相关库,介绍了强大的Python科学计算工具,展示了如何使用Python编程来处理数据科学研究中可能遇到的现实问题,以及如何写出清晰优美的代码。本书“麻雀虽小,肝胆俱全”,不仅探讨了作为计算工具本身的SciPy及其相关的库,还阐释了数据科学研究中一些必要的基础概念,是使用Python编程的数据科学研究人员阅读参考的理想选择。 探索Python科学应用的基础——NumPy 用NumPy和SciPy进行分位数标准化 图像区域网络及区域邻接图 频率与快速傅里叶变换 用稀疏坐标矩阵实现列联表 SciPy中的线性代数 SciPy中的函数优化 用Toolz在笔记本电脑上玩转大数据
内容提要
本书旨在介绍开源的Python算法库和数学工具包SciPy。近年来,基于NumPy和SciPy的完整生态系统迅速发展起来,并在天文学、生物学、气象学和气候科学,以及材料科学等多个学科得到了广泛应用。本书结合大量代码实例,详尽展示了SciPy的强大科学计算能力,包括用NumPy和SciPy进行分位数标准化,用ndimage实现图像区域网络,频率与快速傅里叶变换,用稀疏坐标矩阵实现列联表,SciPy中的线性代数,SciPy中的函数优化等。
目录
前言  ix 章 优雅的NumPy:Python科学应用的基础  1 1.1 数据简介:什么是基因表达  2 1.2 NumPy的N维数组  6 1.2.1 为什么用N维数组代替Python列表  7 1.2.2 向量化  9 1.2.3 广播  9 1.3 探索基因表达数据集  10 1.4 标准化  13 1.4.1 样本间的标准化  13 1.4.2 基因间的标准化  19 1.4.3 样本与基因标准化:RPKM  21 1.5 小结  27 第 2章 用NumPy和SciPy进行分位数标准化  28 2.1 获取数据  30 2.2 独立样本间的基因表达分布差异  30 2.3 计数数据的双向聚类  33 2.4 簇的可视化  35 2.5 预测幸存者  37 2.5.1 进一步工作:使用TCGA患者簇  41 2.5.2 进一步工作:重新生成TCGA簇  41 第3章 用ndimage实现图像区域网络  42 3.1 图像就是NumPy数组  43 3.2 信号处理中的滤波器  48 3.3 图像滤波(二维滤波器)  53 3.4 通用滤波器:邻近值的任意函数  55 3.4.1 练习:康威的生命游戏  56 3.4.2 练习:Sobel梯度幅值  56 3.5 图与NetworkX库  57 3.6 区域邻接图  60 3.7 优雅的ndimage:如何根据图像区域建立图对象  63 3.8 归纳总结:平均颜色分割  65 第4章 频率与快速傅里叶变换  67 4.1 频率的引入  67 4.2 示例:鸟鸣声谱图  69 4.3 历史  74 4.4 实现  75 4.5 选择离散傅里叶变换的长度  75 4.6 更多离散傅里叶变换概念  77 4.6.1 频率及其排序  77 4.6.2 加窗  83 4.7 实际应用:分析雷达数据  86 4.7.1 频域中的信号性质  91 4.7.2 加窗之后  93 4.7.3 雷达图像  95 4.7.4 快速傅里叶变换的进一步应用  99 4.7.5 更多阅读  99 4.7.6 练习:图像卷积  100 第5章 用稀疏坐标矩阵实现列联表  101 5.1 列联表  102 5.1.1 练习:混淆矩阵的计算复杂度  103 5.1.2 练习:计算混淆矩阵的另一种方法  103 5.1.3 练习:多类混淆矩阵  104 5.2 scipy.sparse数据格式  104 5.2.1 COO格式  104 5.2.2 练习:COO表示  105 5.2.3 稀疏行压缩格式  106 5.3 稀疏矩阵应用:图像转换  108 5.4 回到列联表  112 5.5 图像分割中的列联表  113 5.6 信息论简介  114 5.7 图像分割中的信息论:信息变异  117 5.8 转换NumPy数组代码以使用稀疏矩阵  119 5.9 使用信息变异  120 第6章 SciPy中的线性代数  128 6.1 线性代数基础  128 6.2 图的拉普拉斯矩阵  129 6.3 大脑数据的拉普拉斯矩阵  134 6.3.1 练习:显示近邻视图  138 6.3.2 练习挑战:稀疏矩阵线性代数  138 6.4 PageRank:用于声望和重要性的线性代数  139 6.4.1 练习:处理悬挂节点  144 6.4.2 练习:不同特征向量方法的等价性  144 6.5 结束语  144 第7章 SciPy中的函数优化  145 7.1 SciPy优化模块:sicpy.optimize  146 7.2 用optimize进行图像配准  152 7.3 用basin hopping算法避开局部最小值  155 7.4 选择正确的目标函数  156 第8章 用Toolz在笔记本电脑上玩转大数据  163 8.1 用yield进行流处理  164 8.2 引入Toolz流库  167 8.3 k-mer计数与错误修正  169 8.4 柯里化:流的调料  173 8.5 回到k-mer计数  175 8.6 全基因组的马尔可夫模型  177 后记  182 附录 练习答案  186 作者简介  206 封面简介  206
作者介绍

序言

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