轨线系综模型的分子动力学方法
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作者王立飞|责编:宋俊娥
出版社中国水利水电
ISBN9787517087540
出版时间2020-09
装帧其他
开本其他
定价59元
货号1202138095
上书时间2024-06-20
商品详情
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目录
第l章 综述
1.1 背景介绍
1.2 量子相空间理论研究现状分析
1.3 量子轨线方法
1.4 波包动力学理论
1.5 半经典闭合轨道理论的发展
第2章 理论基础
2.1 量子相空间分布函数
2.2 数据统计与分析的密度估计
2.2.1 抽样分布
2.2.2 总体分布的估计
2.2.3 参数估计
2.3 相空间中的量子轨线
2.3.1 相空间动力学
2.3.2 量子轨线
2.3.3 纠缠轨线分子动力学
2.3.4 Husimi分布
2.3.5 相空间自由分配原则
2.4 本章小结
第3章 Wigner相空间中的量子轨线方程
3.1 一维体系
3.2 高维体系
3.3 初始条件
3.4 小结
第4章 自关联函数：纠缠轨线分子动力学方法
4.1 引言
4.2 计算方法
4.3 计算结果以及讨论
4.3.1 三次势
4.3.2 对称的Eckart势垒
4.3.3 非对称的Eckart势垒
4.4 本章小结
第5章 高维体系中的纠缠轨线分子动力学方法
5.1 引言
5.2 计算方法
5.3 计算结果与讨论
5.4 本章小结
第6章 用纠缠轨线分子动力学方法研究H+H：共线反应
6.1 引言
6.2 一维模型
6.3 二维模型
6.4 本章小结
第7章 双势阱中的量子隧穿过程
7.1 引言
7.2 计算方法
7.3 计算结果与讨论
7.4 本章小结
第8章 耗散体系纠缠轨线分子动力学方法
8.1 引言
8.2 计算方法
8.3 数值结果
8.3.1 自由粒子
8.3.2 阻尼谐振子
8.3.3 亚稳态三次势能
8.4 本章小结
第9章 静电场中的氢负离子在弹性墙表面的自关联函数
9.1 引言
9.2 计算方法
9.3 半经典轨线的自关联函数
9.4 静电场中的氢负离子在弹性墙表面的自关联函数
9.5 本章小结
第10章 弹性表面附近氢负离子的光剥离电子波包动力学研究
10.1 引言
10.2 研究内容
10.3 结果和讨论
10.4 本章小结
第11章 金属表面光剥离电子的波包动力学研究
11.1 引言
11.2 研究内容
11.3 结果和讨论
11.4 本章小结
第12章 抑制剂与BRD9结合的分子机理
12.1 引言
12.2 计算方法
12.2.1 初始构象
12.2.2 水中分子动力学模拟
12.2.3 主成分分析
12.2.4 MM.GBSA方法
12.3 结果和讨论
12.3.1 复合物的平衡与柔性
12.3.2 抑制剂结合引起BRD9的内部动力学变化
12.3.3 主成分分析
12.3.4 计算结合自由能
12.3.5 抑制剂与残基相互作用热点的识别
12.4 本章小结
第13章 抑制剂与BRD4结合的分子机理
13.1 引言
13.2 研究内容
13.3 结果和讨论
13.3.1 分子动力学模拟的稳定性
13.3.2 BRD4(1)的动力学行为
13.3.3 结合自由能计算
13.3.4 识别抑制剂与BRD4(1)的相互作用热点
13.4 本章小结
第14章 结论与展望
14.1 结论
14.2 展望
参考文献
内容摘要
本书中利用量子相空间纠缠轨线分子动力学方法，模拟量子效应比较显著的系统，并且给出了量子隧穿现象一个独特的非常吸引人的物理图像。该方法认为轨线系综成员之间存在相互作用，初始能量低于势垒的轨线，可以从其它成员“借取”能量使其本身能量高于势垒，继而越过势垒发生隧穿现象。应用半经典闭合轨道理论，研究了弹性表面氢负离子的光剥离电子的波包动力学研究。应用量子轨线研究了小分子抑制剂与BRD4和BRD9结合的分子机理。
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