常用计算机辅助药物设计软件教程
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全新
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作者编者:张亮仁
出版社中国医药科技
ISBN9787506792158
出版时间2017-04
装帧其他
开本其他
定价42元
货号1201499217
上书时间2024-05-29
商品详情
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目录
第一章 同源模建法预测蛋白质结构
第一节 同源模建概述
第二节 同源模建
第二章 分子对接预测结合位点
第一节 利用AutoDock进行分子对接
第二节 利用D0CK进行分子对接
第三节 利用Surflex-Dock进行分子对接
第四节 利用GOLD进行分子对接
第三章 蛋白质与核酸的分子动力学模拟
第一节 分子动力学概述
第二节 利用GROMACS进行纯蛋白分子动力学模拟
第三节 蛋白与小分子复合物的动力学模拟
第四节 核酸分子动力学模拟
第四章 利用OpenEye组件包进行虚拟筛选
第一节 软件简介
第二节 利用OpenEye组件包进行虚拟筛选
第五章 定量构效关系分析
第一节 CoMFA&CoMSIA
第二节 HQsAR
第六章 药效团
第一节 药效团介绍
第二节 利用Discovery Studio进行药效团模型构建
第七章 全新药物设计
第一节 概述
第二节 利用LigBuilder进行全新药物设计
第八章 作图软件PyMOL的应用
第一节 PyMOL简介
第二节 PyMOL基本操作
第九章 药物设计实例
第一节 利用OpenEye发现F.tularensis烯酰基载体蛋白还原酶FabI抑制剂
第二节 基于模建结构的虚拟筛选发现对虾黄头病毒蛋白酶抑制剂
第三节 基于药效团建模和分子对接的虚拟筛选发现β-分泌酶抑制剂
参考文献
彩图
内容摘要
计算机辅助药物设计已成为一门新兴的研究领域
,在合理药物设计中发挥不可或缺的作用。张亮仁编著的《常用计算机辅助药物设计软件教程》依据实际工作中各种软件的应用,介绍了分子动力学模拟、分子对接、蛋白质同源模建、定量构效关系的研究、药效团的构建、虚拟筛选等内容,且每一内容有不止一
个软件的使用介绍,适合入门计算机辅助药物设计的广大师生参考使用。
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