农业害虫病原真菌基因功能研究
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作者张杰|
出版社科技文献
ISBN9787518995707
出版时间2023-11
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定价58元
货号1203262583
上书时间2024-05-30
商品详情
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作者简介
张杰(1975-),周口师范学院教师,男,出生于河南太康县,副教授,博士,重庆大学生命科学学院毕业,研究方向生物学,曾合著有《生物工程与技术导论》,发表论文30多篇。
目录
\"第一章导论
11研究背景
12研究现状
121真菌侵染过程的研究
122真菌产生代谢物的研究
123侵染后的宿主防御研究
124相互作用的三级程度研究
125被侵染的昆虫致死性行为变化研究
126昆虫病原菌的传播方式研究
127昆虫宿主-病原菌模型的遗传多样性研究现状
128昆虫病原真菌的流行病学研究
129建模
1210控制潜力
1211毒力基因与非毒力基因
13研究技术路线
第二章基因功能的实验研究过程
21载体结构
22质粒的扩大培养与提取(以天根质粒提取试剂盒为例)
23质粒酶切
24回收酶切质粒(OMEGA凝胶回收试剂盒)
25目的基因的寻找与电子PCR
26酶切位点分析
27引物设计和接头添加
28PCR扩增
29上样电泳
210PCR产物回收
211酶切质粒回收物和PCR纯化产物的连接
212感受态大肠杆菌转化
213阳性克隆鉴定
214靶基因的下游片段重组
215重组完整的质粒电转到农杆菌
216农杆菌侵染目标真菌
217真菌转化子培养与PCR验证
2171真菌转化子培养与PCR验证过程
2172微量DNA提取试剂配方
218真菌转化子的Southern Blotting杂交验证
2181真菌基因组DNA提取
2182Southern Blotting杂交操作
第三章基因功能的生物信息学研究
31Motif的分析与再现
311序列下载
312Motif分析
313Motif分析再现
314MEME的应用
32Motif的批量分析方法
321文件准备
322导入数据与设置
323细节调整与文件保存
324空间位置大小调节
325文本设置
326其他
33多基因组比对和共线性分析Mauve软件
34蛋白质三维结构预测(SWISS-MODEL)
35同源性分析—进化树构建
351Mega软件构建进化树
352clustalx与Mega联合构建进化树
353在线比对与Mega联合构建进化树
354构建系统发育树需要注意的问题
355系统发育树的美化
36小RNA分析方法
361数据下载
362mRNA差异表达
363lncRNA差异表达
364miRNA差异表达
365ceRNA网络构建
37基因编码蛋白的二级结构预测
371PSIPRED Workbench在线预测
372COILS在线预测卷曲结构
373Jpred4在线预测
374scratchproteomics在线预测
375Predict Protein在线预测
376信号肽的在线预测
38蛋白质的物理化学性质预测
39基因的模体识别与解析
310蛋白结构的可视化
311基因的富集信号通路分析
312分子对接分析
3121分子对接的基础
3122Chimera软件分子对接过程
3123分子对接细节展示
3124分子对接结果平面化
313蛋白活性口袋的预测
314antiSMASH数据库—微生物次生代谢物合成基因簇查询和预测
315蛋白的多级构比对分析
316Circos在线绘图
第四章蝗绿僵菌微管蛋白(β-tubulin)基因的功能
41研究背景
42研究的内容
43实验材料
431主要仪器设备
432主要试剂和培养基
44实验方法
441菌株和培养条件
442生物信息学分析
443真菌基因组DNA和RNA提取
444荧光染色及观察
445Southern blotting
446载体构建及转化子的获得
447孢子和虫菌体的计数
448产孢量的测定
449昆虫生测
4410PCR扩增程序和条件
4411数据处理
45结果分析
451蝗绿僵菌β-tubulin基因的生物信息学分析
452蝗绿僵菌目标基因β-tubulin基因敲除和回复转化子的验证
453蝗绿僵菌β-tubulin基因对菌落形态和菌丝形态的影响
454蝗绿僵菌β-tubulin基因对毒力的影响
455蝗绿僵菌β-tubulin基因对产孢的影响
456蝗绿僵菌β-tubulin基因对侵染结构附着胞的影响
457蝗绿僵菌β-tubulin基因在细胞核事件中的功能
46讨论
第五章蝗绿僵菌MaPpt1负调控微循环产孢和紫外抗性
51研究背景
52研究内容和技术路线
521研究内容
522研究技术路线
53实验材料
531主要仪器设备
532主要试剂和培养基
54实验方法
541菌株和培养条件
542生物信息学分析
543真菌基因组DNA和RNA提取
544荧光染色及观察
545Southern blotting
546载体构建及转化子的获得
547孢子和虫菌体的计数
548产孢量的测定
549昆虫生测
5410RNA的提取和定量分析
5411磷酸化蛋白质组学分析
5412数据处理
55结果分析
551蝗绿僵菌MaPpt1基因的生物信息学分析
552蝗绿僵菌MaPpt1目标基因的敲除和回复菌株的构建
553蝗绿僵菌MaPpt1对菌落表型的影响
554蝗绿僵菌MaPpt1对产孢量的影响
555蝗绿僵菌MaPpt1对紫外逆境抗性的影响
556蝗绿僵菌中MaPpt1在湿热逆境中的作用和表达模式的分析
557MaPpt1在紫外和湿热逆境中的作用
558蝗绿僵菌MaPpt1在不同培养基上对产孢的影响
559蝗绿僵菌MaPpt1对毒力的影响
5510蝗绿僵菌MaPpt1调控的信号途径材料的选择及RNA质量评估
5511蝗绿僵菌MaPpt1 基因的敲除改变了产孢的信号途径
5512蛋白质组学分析MaPpt1在产孢和UV抗性的作用机制
5513MaPpt1调控的基因网络
56讨论
第六章主要结论与展望
附录
AqRT-PCR数字表达谱验证结果
B蛋白质组学分析结果
C蛋白质组学质谱图
D缩略词
E常用色素配制及使用方法
F常用抗生素配制及使用方法
G常用培养基
H常用试剂配制方法
I常用酸碱指示剂及变化范围
J常用生物鉴定引物\"
内容摘要
本书属于农业害虫病原真菌基因的反向遗传学方面的著作,有导论、基因功能的实验研究过程、基因功能的生物信息学研究、蝗绿僵菌微管蛋白(B-TUBULIN)基因的功能、蝗绿僵菌MAPPT1负调控微循环孢和紫外抗性、主要结论与展望等部分组成,全书以害虫病原真菌为研究对象,分析昆虫病原真菌基因功能研究的技术,阐述基因功能研究技术过程和详细的操作方法,通过案例介绍了其研究的结果和基因被赋予的功能,对基因修饰、编
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