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组学机器学习

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广东广州
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作者刘琦

出版社科学出版社

ISBN9787030761514

出版时间2023-10

装帧平装

开本16开

定价198元

货号1203104328

上书时间2024-06-29

曲奇书店

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   商品详情   

品相描述:全新
商品描述
目录
第一部分 组学机器学习导论

第1章 组学机器学习概述 3

1.1 组学概述 3

1.2 组学机器学习 6

1.3 本章小结 8

参考文献 10

第二部分 组学的表征学习

第2章 组学的表征——度量13

2.1 度量学习 13

2.2 案例一:基于参考单细胞转录组进行细胞类型识别的度量学习 17

2.3 案例二:整合多个参考单细胞组进行细胞类型识别的度量学习 34

2.4 案例三:药物基因组的度量学习 47

2.5 本章小结 58

参考文献 58

第3章 组学的表征——嵌入66

3.1 嵌入66

3.2 案例:CRISPR功能基因组的嵌入学习72

3.3 本章小结 83

参考文献 84

第4章组学的表征——多模态整合 87

4.1多模态整合87

4.2案例:单细胞RNA-seq和单细胞ATAC-seq多模态整合 95

4.3本章小结 114

参考文献114

第三部分 组学的弱监督学习

第5章 组学的不完备监督——半监督学习 123

5.1 半监督学习 123

5.2 案例:抗癌药物组合预测的半监督学习 127

5.3 本章小结 138

参考文献138

第6章 组学的不完备监督——迁移学习141

6.1 迁移学习 141

6.2 案例一:基因编辑系统优化设计的迁移学习146

6.3 案例二:药物小分子设计的迁移学习 158

6.4 本章小结 166

参考文献167

第7章 组学的不完备监督——元学习 171

7.1 元学习171

7.2 案例:抗原 -TCR识别的元学习 175

7.3 本章小结 186

参考文献187

第8章 组学的不完备监督——主动学习190

8.1 主动学习 190

8.2 案例:基于主动学习的化学反应定量建模 198

8.3 本章小结 208

参考文献208

第四部分 组学的隐私计算

第9章 组学的隐私保护——联邦学习 217

9.1 联邦学习 217

9.2 案例一:药物小分子定量构效关系建模的联邦学习 220

9.3 案例二:单细胞组学整合的联邦学习 225

9.4 本章小结 233

参考文献 234

总结与展望 237

术语表 239

内容摘要
人工智能驱动的组学挖掘是数据驱动的生物医学研究的支撑技术。组学测序技术逐步向多尺度、跨模态、有扰动等方向发展,但体现出的高维度、高噪声、多模态、标记稀缺等特点,成为制约其有效挖掘的瓶颈。《组学机器学习》面向生命组学数据特点,较为系统和深入地对组学机器学习的主要研究范式、适用场景、分析方法、理论思想进行介绍。结合相应组学挖掘的具体研究案例,向读者展示组学人工智能驱动的生命健康交叉研究的绚烂图景。本书适合生命科学、医学、生物信息学、计算机和信息科学等相关交叉专业的高年级本科生、研究生,以及人工智能领域的科研人员和产业人员参考使用。

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