计算生物学导论——图谱、序列和基因组
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作者(美)M.S.Waterman
出版社科学出版社
ISBN9787030251565
出版时间2009-08
装帧平装
开本其他
定价128元
货号1202219608
上书时间2024-06-08
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目录
《生物数学丛书》序
前言
数学符号
第0章 引言
0.1 分子生物学
0.2 数学，统计和计算机科学
第1章 分子生物学一些知识
1.1 DNA和蛋白
1.1.1 双螺旋结构
1.2 中心定理
1.3 遗传密码
1.4 转化RNA和蛋白序列
1.5 基因不简单
1.5.1 开始与停止
1.5.2 基因表达的控制
1.5.3 割裂基因
1.5.4 跳跃基因
1.6 生物化学
问题
第2章 图谱
2.1 引言
2.2 图
2.3 区间图
2.4 片段大小的度量
问题
第3章 多重图谱
3.1 双消化问题
3.1.1 双消化问题的多重解
3.2 多重解分类
3.2.1 反射性
3.2.2 重叠等价
3.2.3 重叠尺寸等价
3.2.4 更多的图论知识
3.2.5 从一条路到另一条路
3.2.6 图谱及边界块图
3.2.7 图谱的盒变换
3.2.8 一个例子
问题
第4章 求解DDP的算法
4.1 算法和复杂性
4.2 DDP是NP接近的
4.3 解DDP的方法
4.3.1 整数规划
4.3.2 划分问题
4.3.3 TSP
4.4 模拟退火法：TSP和DDP
4.4.1 模拟退火法
4.4.2 TSP
4.4.3 DDP
4.4.4 环状图谱
4.5 用真实数据作图
4.5.1 使数据符合图
4.5.2 图谱算法
问题
第5章 克隆与克隆文库
5.1 有限的随机克隆数
5.2 接近消化的文库
5.3 部分消化的文库
5.3.1 可克隆基的组分
5.3.2 采样、方法1
5.3.3 设计部分消化文库
5.3.4 Poisson近似
5.3.5 获得所有片段
5.3.6 优选表达度
5.4 每个微生物中的基因组
……
第6章 物理基因组图谱：海洋、岛屿和锚
第7章 序列装配
第8章 数据库和快速序列装配
第9章 动态规划、两个序列比对
第10章 多重序列比对
第11章 序列比对用到的概率和统计
第12章 有关序列模式的概率与统计
第13章 RNA二级结构
第14章 树和序列
第15章 来源与展望
参考文献
附录 问题解答和提示
索引
内容摘要
《计算生物学导论：图谱、序列和基因组》是Introduction to Computational Biology的中文译著，《计算生物学导论：图谱、序列和基因组》的意图是针对有数学技能的人介绍令人着迷的生物数据和问题，并建立更实际的生物数学的基础。《计算生物学导论：图谱、序列和基因组》共分15章，其中第1章介绍分子生物学的基本常识，第2-4章介绍图谱和多重图谱，第5、6章研究克隆和克隆图谱，第7章讨论DNA序列相关的话题，第8-11章是共同模式下序列比较问题，第12章涉及序列中模式计数的统计问题，第13章叙述RNA二级结构的数学化论述，第14章给出有关序列的进化历史，书末第15章给出某些关键文献的原始出处。《计算生物学导论：图谱、序列和基因组》结构完整，内容更新、更全面，《计算生物学导论：图谱、序列和基因组》适合高等院校数学和生物专业的高年级大学生、研究生和教师阅读参考，也适合科研单位的研究人员参考。
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