• 基于高通量测序的基因组分析
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基于高通量测序的基因组分析

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作者王峥峰

出版社科学出版社

出版时间2022-06

版次31

装帧其他

上书时间2024-10-03

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品相描述:全新
图书标准信息
  • 作者 王峥峰
  • 出版社 科学出版社
  • 出版时间 2022-06
  • 版次 31
  • ISBN 9787030721488
  • 定价 108.00元
  • 装帧 其他
  • 开本 16开
  • 页数 160页
  • 字数 202千字
【内容简介】
高通量测序已成为生物学研究的重要手段,在生物多样性、物种种质资源开发利用和生物医药领域都发挥了非常重要的作用,因此,如何处理和分析高通量测序数据成为生物学研究的必备技能之一。本书以高通量测序数据在基因组分析中的运用为例,采用分步讲解的方式,图文并茂地介绍了高通量测序数据的基本格式,利用高通量测序数据开展分析的流程、相关程序,程序执行过程及其分析注意事项。同时,对于数据分析运算中的一些中间结果,作者提供了自己编写的程序,以利于获得最终结果。书中提供了Linux操作系统安装方法,并基于Linux语言命令介绍了高通量测序数据处理过程,其中没有复杂的程序代码,不需要编程语言基础,浅显易懂,具有很强的实践操作性。
【目录】


章  linux系统安装

第二章  linux基本命令

第三章  高通量测序数据的常见格式

第四章  基因组组装

节  基因组大小估测

第二节  基于pacbio hifi模式测序数据的基因组组装

第三节  基于pacbio clr模式测序数据的基因组组装

第四节  基于nanopore测序数据的基因组组装

第五节  去除基因组中的冗余序列

第六节  hi-c组装

第五章  重复序列查找

第六章  基因预测

第七章  基因家族扩张和收缩

第八章  物种历史动态

第九章  群体重测序个体的snp查找

第十章  遗传多样参数计算

第十一章  受选择作用的snp位点

节  pcadapt分析

第二节  baypass分析

第三节  合并pcadapt和baypass结果

第十二章  遗传结构分析

节  pca分析

第二节  admixture分析

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