生物信息学中的数学方法引论

图书标准信息

• 作者 [澳大利亚]伊萨耶夫（Alexander Isaev） 著
• 出版社 科学出版社
• 出版时间 2011-06
• 版次 1
• ISBN 9787030313812
• 定价 78.00元
• 装帧 精装
• 开本 16开
• 纸张 胶版纸
• 页数 294页
• 字数 380千字
• 正文语种 英语
• 丛书 国外数学名著系列

【内容简介】

《生物信息学中的数学方法引论》的特色之一就是没有对所有的生物信息学问题进行泛泛的介绍，而是选择了生物信息学中核心问题之一--序列分析作为《生物信息学中的数学方法引论》的主要内容。由于缩小了范围，作者可以在有限的篇幅中更详尽的介绍序列分析的各种数学模型和算法。

【目录】

PartISequenceAnalysis
1Introduction:BiologicalSequences
2SequenceAlignment
2.1SequenceSimilarity
2.2DynamicProgramming:GlobalAlignment
2.3DynamicProgramming:LocalAlignment
2.4AlignmentwithAffineGapModel
2.5HeuristicAlignmentAlgorithms
2.5.1FASTA
2.5.2BLAST
2.6SignificanceofScores
2.7MultipleAlignment
2.7.1MSA
2.7.2ProgressiveAlignment
Exercises

3MarkovChainsandHiddenMarkovModels
3.1MarkovChains
3.2HiddenMarkovModels
3.3TheViterbiAlgorithm
3.4TheForwardAlgorithm
3.5TheBackwardAlgorithmandPosteriorDecoding
3.6ParameterEstimationforHMMs
3.6.1EstimationwhenPathsareKnown
3.6.2EstimationwhenPathsareUnknown
3.7HMMswithSilentStates
3.8ProfileHMMs
3.9MultipleSequenceAlignmentbyProfileHMMs
Exercises
XContents

4ProteinFolding
4.1LevelsofProteinStructure
4.2PredictionbyProfileHMMs
4.3Threading
4.4MoleCularModeling
4.5LatticeHP-Model
Exercises

5PhylogeneticReconstruction
5.1PhylogeneticTrees
5.2ParsimonyMethods
5.3DistanceMethods
5.4EvolutionaryModels
5.4.1TheJukes-CantorModel
5.4.2TheKimuraModel
5.4.3TheFelsensteinModel
5.4.4TheHasegawa-Kishino-Yano(HKY)Model
5.5MaximumLikelihoodMethod
5.6ModelComparison
Exercises
PartIIMathematicalBackgroundforSequenceAnalysis

6ElementsofProbabilityTheory
6.1SampleSpacesandEvents
6.2ProbabilityMeasure
6.3ConditionalProbability
6.4RandomVariables
6.5IntegrationofRandomVariables
6.6MonotoneFunctionsontheRealLine
6.7DistributionFunctions
6.8CommonTypesofRandomVariables
6.8.1TheDiscreteType
6.8.2TheContinuousType
6.9CommonDiscreteandContinuousDistribution,,
6.9.1TheDiscreteCase
6.9.2TheContinuousCase
6.10Vector-ValuedRandomVariables
6.11SequencesofRandomVariables
Exercises
……