基于高通量测序的基因组分析

图书标准信息

• 作者 王峥峰
• 出版社 科学出版社
• 出版时间 2022-06
• 版次 31
• ISBN 9787030721488
• 定价 108.00元
• 装帧 其他
• 开本 16开
• 页数 160页
• 字数 202千字

【内容简介】

高通量测序已成为生物学研究的重要手段，在生物多样性、物种种质资源开发利用和生物医药领域都发挥了非常重要的作用，因此，如何处理和分析高通量测序数据成为生物学研究的必备技能之一。本书以高通量测序数据在基因组分析中的运用为例，采用分步讲解的方式，图文并茂地介绍了高通量测序数据的基本格式，利用高通量测序数据开展分析的流程、相关程序，程序执行过程及其分析注意事项。同时，对于数据分析运算中的一些中间结果，作者提供了自己编写的程序，以利于获得最终结果。书中提供了Linux操作系统安装方法，并基于Linux语言命令介绍了高通量测序数据处理过程，其中没有复杂的程序代码，不需要编程语言基础，浅显易懂，具有很强的实践操作性。

【目录】

章  linux系统安装

第二章  linux基本命令

第三章  高通量测序数据的常见格式

第四章  基因组组装

节  基因组大小估测

第二节  基于pacbio hifi模式测序数据的基因组组装

第三节  基于pacbio clr模式测序数据的基因组组装

第四节  基于nanopore测序数据的基因组组装

第五节  去除基因组中的冗余序列

第六节  hi-c组装

第五章  重复序列查找

第六章  基因预测

第七章  基因家族扩张和收缩

第八章  物种历史动态

第九章  群体重测序个体的snp查找

第十章  遗传多样参数计算

第十一章  受选择作用的snp位点

节  pcadapt分析

第二节  baypass分析

第三节  合并pcadapt和baypass结果

第十二章  遗传结构分析

节  pca分析

第二节  admixture分析