生物信息学实验
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作者陈铭，原春晖
出版社科学出版社
ISBN9787030716897
出版时间2023-10
装帧平装
开本16开
定价29.8元
货号29394019
上书时间2024-11-03
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商品详情
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导语摘要
本书是《生物信息学》（科学出版社出版，陈铭主编）的配套实验教程，由浅入深，全面地介绍了生物信息学涉及的实验方法。全书共12个章节，涵盖了生物信息学需要掌握的基础计算机技术，如Linux系统、R语言的基本操作命令；以及数据库使用、序列比对、进化分析、基因预测、转录组分析、转录调控分析、单细胞转录组分析、蛋白质分析以及系统生物学相关的实验。每个章节先对实验进行简单介绍，然后通过案例进行操作步骤的详细介绍。
目录
目录
前言
实验1 Linux系统入门与操作
实验1-1 文件与目录管理
实验1-2 文本输入
实验1-3 系统管理
实验1-4 Linux系统中的软件安装
实验2 R语言基础
实验2-1 R语言的基本操作
实验2-2 使用R语言计算并安装R程序包
实验2-3 使用R语言画图
实验3 NCBI、ENA和DDBJ数据库的序列获取
实验3-1 NCBI数据库序列数据的获取
实验3-2 ENA数据库文件的下载
实验3-3 使用DDBJ数据库下载测序数据
实验4 双序列比对
实验5 多序列比对分析
实验6 进化分析
实验7 基因预测
实验7-1 基因翻译蛋白
实验7-2 基因编码区预测
实验8 转录组分析
实验8-1 转录组数据准备
实验8-2 质控
实验8-3 序列映射
实验8-4 转录本定量
实验8-5 差异表达分析
实验8-6 基因集功能富集分析
实验8-7 加权基因共表达网络分析
实验9 转录调控分析
实验9-1 miRNA靶基因分析
实验9-2 ceRNA调控分析
实验10 单细胞转录组分析
实验10-1 单细胞转录组数据矩阵的获取
实验10-2 单细胞转录组数据的下游分析
实验11 蛋白质分析
实验11-1 蛋白质结构同源建模
实验11-2 蛋白质结构可视化分析
实验11-3 蛋白质-小分子的分子对接
实验11-4 蛋白质组定量分析
实验12 Cytoscape系统生物学
参考文献
附录1 思政小课堂
附录2 常用软件介绍及下载
内容摘要
本书是《生物信息学》（科学出版社出版，陈铭主编）的配套实验教程，由浅入深，全面地介绍了生物信息学涉及的实验方法。全书共12个章节，涵盖了生物信息学需要掌握的基础计算机技术，如Linux系统、R语言的基本操作命令；以及数据库使用、序列比对、进化分析、基因预测、转录组分析、转录调控分析、单细胞转录组分析、蛋白质分析以及系统生物学相关的实验。每个章节先对实验进行简单介绍，然后通过案例进行操作步骤的详细介绍。
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