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蛋白质结合位点预测及辅助分子对接

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作者邱智军

出版社化学工业出版社

ISBN9787122383150

出版时间2021-02

版次1

装帧平装

开本16开

纸张胶版纸

页数160页

字数169千字

定价88元

货号SC:9787122383150

上书时间2024-10-14

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商品描述
主编推荐:
本书介绍了精度和效率更高的基于计算的蛋白质结合位点识别方案,可为蛋白质结构与功能、计算机辅助药物设计等方向的相关研究与开发人员提供参考。
内容简介:
  
蛋白质结合位点的识别对深入理解蛋白质的生物学功能具有重要的意义。本书致力于从描述特征、残基定义和数据筛选三个方面进行优化,从而构建蛋白质结合位点预测的有效方法,主要内容包括基于氨基酸组成偏好的配体结合口袋识别方法、使用随机森林方法进行蛋白质结合位点的预测和基于数据聚类的蛋白质结合位点识别,并在此基础上介绍了相关的辅助分子对接应用研究。

本书可作为生物信息学及计算机辅助药物设计等相关专业研究生、教师和科研人员的参考用书。

目录:
第1章绪论001

1.1引言001

1.2蛋白质结构与功能004

1.2.1一级结构004

1.2.2二级结构006

1.2.3三级结构006

1.2.4四级结构007

1.2.5蛋白质稳定性008

1.2.6蛋白质结构分析008

1.2.7蛋白质结构稳定性分析009

1.2.8蛋白质功能009

1.3配体-受体相互作用原理010

1.3.1受体-配体结合的关键点010

1.3.2结合过程理论模型010

1.3.3配体-受体相互作用的物理学性质013

1.4蛋白质结合位点预测研究现状018

1.4.1蛋白质-蛋白质和蛋白质-配体结合位点的比较019

1.4.2蛋白质-配体结合位点预测020

1.4.3蛋白质-蛋白质结合位点预测029

1.5本研究的主要工作033

1.5.1基于氨基酸组成偏好的配体结合口袋识别方法034

1.5.2使用随机森林方法进行蛋白质结合位点的预测034

1.5.3残基聚类方法及其对蛋白质结合位点预测的应用035

1.5.4蛋白质结合位点预测辅助分子对接035

第2章基于氨基酸组成偏好的配体结合口袋识别方法037

2.1引言037

2.2基于全局口袋氨基酸组成偏好的配体结合口袋识别方法038

2.2.1材料与方法038

2.2.2结果与讨论046

2.3基于局部口袋氨基酸组成偏好的配体结合口袋识别方法051

2.3.1材料与方法051

2.3.2结果与讨论053

2.4本章小
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