蛋白质模拟
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作者王存新 等 编著
出版社科学出版社
ISBN9787030473271
出版时间2016-03
版次1
装帧平装
开本16开
纸张胶版纸
页数421页
字数650千字
定价138元
货号SC:9787030473271
上书时间2024-05-07
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商品详情
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作者简介:
王存新，1943年11月生，教授，博士生导师。1968年毕业于中国科学技术大学，1978～1998年在中国科大任教，1998年作为学术带头人调入北京工业大学工作。曾赴美国、法国、意大利从事合作研究多年。主要从事蛋白质模拟和药物设计研究。主持完成国家及省部级科研项目20余项，培养硕士、博士研究生50余人，在靠前外学术期刊上发表论文200余篇，出版专著2部、译著1部，获国家发明专利10余项。曾获国家自然科学奖三等奖、中国科学院自然科学奖二等奖、国务院颁发的政府特殊津贴、北京市突出贡献专家、北京市很好教师、北京市教学名师等多项奖励和荣誉称号。
内容简介:
本书对蛋白质分子模拟领域的原理、发展和应用，特别是对该领域的热点和难点问题，结合实际进行了深入的讨论。力求做到理论联系实际，学术思想新颖。主要包括以下六方面的内容：一、分子动力学模拟方法。二、蛋白质复合物结构预测。三、用分子模拟方法研究蛋白质折叠。四、关于粗粒化模型。六、药物分子设计方法与应用。本书的内容涉及分子模拟领域十分广阔的范围，各章节的作者都在该研究领域进行过多年的实践，并做出过很好很好的工作，具有分子模拟方面的丰富的研究经验。
目录:
第一部分分子动力学模拟方法
第1章分子动力学模拟的原理、方法与进展
1.1引言
1.2生物大分子的经典力学模型与常见力场
1.2.1经典力学模型
1.2.2常见分子力场
1.3积分算法
1.3.1体系的动力学方程
1.3.2动力学方程的数值解法
1.4周期性边界条件
1.5约束条件动力学模拟
1.5.1SHAKE算法
1.5.2LINCS算法
1.6非键相互作用
1.6.1短程相互作用
1.6.2MD模拟中长程静电相互作用的常用算法
1.7恒温恒压分子动力学模拟
1.7.1温度控制方法
1.7.2压力控制方法
1.8溶剂模型
1.8.1隐含溶剂模型
1.8.2显含溶剂模型
1.9分子动力学模拟的主要步骤
1.10蛋白质分子动力学模拟的进展与前景
参考文献
第2章拉伸分子动力学模拟
2.1引言
2.2拉伸分子动力学模拟方法
2.3拉伸分子动力学模拟实例
2.3.1周质结合蛋白与配体相互识别研究
2.3.2抗癌多肽p28与肿瘤抑制蛋白p53的拉伸分子动力学研究
参考文献
第3章膜蛋白体系的分子动力学模拟
3.1引言
3.2膜蛋白分子动力学模拟研究进展
3.2.1膜的性质和脂质分子的类型
3.2.2膜蛋白的性质和类型
3.2.3分子动力学模拟在膜研究方面的应用
3.2.4分子动力学模拟在膜蛋白体系的应用
3.3膜蛋白体系分子动力学模拟的基本方法和步骤
3.4BtuC—POPC膜蛋白体系的分子动力学模拟
3.4.1研究背景
3.4.2材料和方法
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