系统生物学
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作者雷锦誌
出版社科学出版社
ISBN9787030774491
出版时间2019-05
版次1
装帧平装
开本其他
纸张胶版纸
定价218元
货号SC:9787030774491
上书时间2024-09-18
商品详情
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内容简介:
系统生物学是综合了生物、数学、物理和信息技术等在内的交叉学科，所涉及学科众多、内容复杂。本书从生物学和数学建模与分析计算交叉的角度出发，结合作者近年的研究工作和国内外一些新的研究进展，介绍了系统生物学这门学科的基本概念、方法和研究思路。内容涵盖生物化学反应的数学描述、基因表达过程的随机模拟、基因调控的数学模型及其在生物钟和钙振荡动力学分析的应用、芽殖酵母细胞命运抉择动力学模型、信号分子浓度梯度形成的数学模型、干细胞增殖动力学的数学模型及其在造血系统动力学中的应用、复杂生物过程的关键点检测、霍奇金-赫胥黎方程、能量函数与生物大分子识别。所涉及的数学方法包括随机模拟、常微分方程模型、时滞微分方程模型、反应-扩散方程模型、分岔分析、数据分析等。
本书可供生物、医学、数学、物理、化学、生物信息学、生物物理学等方向的学生、教师和相关研究人员参考。
目录:
第1章 生物化学反应的数学描述 1
1.1 生物化学反应系统 2
1.2 化学主方程 4
1.2.1 方程的建立 4
1.2.2 化学主方程的性质 6
1.2.3 吉莱斯皮算法 9
1.3 化学速率方程 11
1.3.1 方程的建立 11
1.3.2 涨落耗散定理 13
1.4 化学朗之万方程 16
1.4.1 方程的建立 16
1.4.2 随机积分的简单讨论 21
1.4.3 Tau-跳跃算法 22
1.5 福克尔-普朗克方程 24
1.6 反应速率随时间变化的生化反应系统 25
1.6.1 外部噪声干扰下的反应速率 26
1.6.2 推广的化学朗之万方程 27
1.6.3 伊藤积分与斯特拉托诺维奇积分 28
1.6.4 有色噪声 29
1.7 本章小结 30
补充阅读材料 31
思考题 31
第2章 基因表达过程的随机模拟 33
2.1 遗传信息的传递与基因表达 33
2.2 基因表达的内蕴随机性 36
2.2.1 模型的建立 37
2.2.2 统计平衡态 38
2.2.3 静态涨落 39
2.2.4 内蕴随机效应 41
2.2.5 转录水平的分布 42
2.3 基因表达中的外部噪声 46
2.3.1 模型的建立 46
2.3.2 统计平衡态 49
2.3.3 静态涨落 50
2.3.4 外部噪声对基因表
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