医学生物信息学案例与实践
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作者华琳,李林 主编
出版社清华大学出版社
ISBN9787302486947
出版时间2018-01
版次1
装帧平装
开本16开
纸张胶版纸
页数253页
字数349千字
定价39元
货号SC:9787302486947
上书时间2024-08-16
商品详情
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作者简介:
华琳，首都医科大学生物医学工程学院副教授，博士，硕士研究生导师，研究方向为生物统计与生物信息学。主讲《医学统计学》、《医用数据挖掘》、《医药数理统计方法》和《生物信息学技术概论》等课程。擅长统计研究设计、各类型数据统计分析、数据挖掘及生物信息学分析，近5年内在相关领域以靠前作者和通讯作者发表论文30余篇，其中SCI论文近20篇，累计影响因子超过20.0。主持和参与多项重量、省部级和局级科研课题，与北京多家临床医院开展了数据分析方面的合作，并建立了良好的合作关系，目前是首都医科大学中青年骨干教师和北京市中青年骨干教师。
内容简介:
随着各种基因测序技术的兴起以及互联网的普及，医学科学已经进入基因组学、蛋白质组学、转化医学和精准医学的新时代，生物信息学在此背景下得到了快速发展。本书从医学和分子生物学角度出发，通过案例分析详细介绍常用的生物信息学数据库、基因芯片数据、RNA测序数据、单核苷酸多态SNP数据、DNA甲基化数据等的处理分析，还包括基因功能与通路分析技术、疾病风险通路的筛选、生物分子网络的构建等。本书还详细介绍了R软件及Bioconductor生物信息学软件包的使用，重点突出实用性和可操作性，以帮助读者对医学生物信息学方法的理解和掌握。本书主要取材于编者近年来从事医学生物信息学的研究与教学工作内容，很多案例来自于编者近年来的科研实践。本书既可以作为基础医学、临床医学、预防医学等高年级本科生和研究生的“医学生物信息学”课程教材，也可供相关的生物科技人员阅读和参考。
目录:
基础篇
第1章生物信息学绪论3
1.1生物信息学概述3
1.2医学生物信息学的主要研究内容4
1.3医学生物信息学面临的挑战5
第2章生物信息学数据库6
2.1生物信息学数据库简介6
2.2基因数据库6
2.2.1GenBank-NCBI核酸序列数据库6
2.2.2DDBJ数据库8
2.2.3EMBL数据库8
2.2.4UniGene数据库8
2.3蛋白质数据库9
2.3.1SWISS-PROT蛋白质序列分析数据库9
2.3.2PDB蛋白质结构数据库9
2.3.3SCOP数据库11
2.4突变数据库11
2.5UCSC基因组浏览数据库11
2.6OMIM数据库 12
2.7集成数据库12
第3章核酸同源性序列比对的策略和方法14
3.1数据库中的相似性搜索14
3.2双序列比对14
3.3BLAST搜索实例15
3.3.1BLAST简介15
3.3.2BLAST的操作步骤16
3.4分子进化与系统发生树20
3.4.1分子进化20
3.4.2系统发生树20
3.5下一代测序技术简介22
医学生物信息学案例与实践目录
第4章人类基因组变异数据库及SNP关联分析24
4.1SNP简介24
4.2dbSNP数据库简介25
4.3SNP关联分析28
4.3.1SNP关联分析介绍28
4.3.2plink软件批量实现SNP关联分析29
4.4基因与基因互作分析32
4.4.1Logistic回归分析32
4.4.2多因子降维法33
4.4.3决策树分析35
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