1 在赵翼《廿二史劄记》上的识语(一九〇三年)
2 《柱下备忘录》中《满洲魂》一册封面(一九〇五年前后)
3 光华医社配便通用方药录(一九〇八年至一九一一年)
4 《四书五经上帝考》(约一九一七年初)
5 《景教三威蒙度赞》跋(一九一七年二月)
6 《元也里可温教考》资料、初稿、改稿、定稿(一九一七年春至一九三四年)
7 在日本奈良东大寺大佛尊影参观券上题词及当天日记(一九一七年十一月九日:
8 《两眼考》抄本封面题字及识语(一九一八年六月廿三日)
9 《开封一赐乐业教考》资料(一九一九年)
10 对《四库全书》的研究(一九二〇年至一九二二年)
11 《火祆教人中国考》定稿(一九二二年四月廿一日)
12 《摩尼教入中国考》手稿(一九二二年六月、九月)
13 赵映乘试卷识语稿(一九二二年十月二日)
14 《元西域人华化考》手稿(一九二二年至一九二五年)
15 《中西回史日历》、《二十史朔闰表》稿(一九二二年至一九二五年)
16 《黄钧选先生暨罗夫人七十双寿序》稿(一九二三年九月)
17 在梁启超《中国历史研究法》上所作的批语(一九二三年至一九二四年)
18 《道家金石略》稿(一九二三年至一九二四年)
19 致廖世功函谈《四库全书》底本(一九二四年二月十五日)
20 《跋赡思书哈珊碑》稿(一九二四年五月)
21 《中国基督教史讲义目录》稿(一九二四年)
22 创办孤儿工读园和平民中学情况(一九二五年)
23 致王国维函稿谢提供李殉资料(一九二五年二月)
24 致叶恭绰函稿谈故宫展览书画事(一九二五年六月二十二日)
25 《关于谚语赵老送灯台》稿(一九二五年九月)
26 跋教王禁约及康熙谕西洋人(一九二五年十一月)
27 《元苌振兴温泉颂碑跋》稿(一九二六年一月)
28 《蹇斋剩墨跋》稿(一九二六年一月)
29 《回回教入中国史略》提纲(一九二七年初)
30 《史学名著评论》课教材(一九二八年至一九四六年)
31 《中国史料的整理》讲稿(一九二九年五月二十七日)
32 《大唐西域记撰人辩机》稿(一九三〇年二月)
33 二陈笔谈遗墨(约一九三○年底)
34 《校勘学释例》手稿散页(一九三一年七月)
35 《广书林扬觯》提纲(一九三一年至一九三二年)
36 陈恭尹赠王烘入蜀卷识语稿《一九三三年一月)
37 致胡适函稿谈《元秘史》译音用字(一九三三年三月七日)
38 致孙楷第、王重民函拟荐入辅仁大学任教(一九三三年六月二十六日)
39 《方孝标方苞轶事》、《彭家屏轶事》稿(一九三三年七月)
40 《景印四库全书未刊本草目签注》稿(一九三三年八月)
47 《题鲍润生司铎译楚辞》诗稿(约一九三四年)
42 《从教外典籍见明末清初之天主教》付印稿(一九三四年三四月)
43 《记吕晚村子孙》稿(一九三五年六月)
44 《墨井集·口铎》校记(一九三五年)
45 家书谈书法(一九三六年三月七日)
46 《四库提要中之周亮工》改定稿(一九三六年九月)
47 《吴渔山先生年谱》初稿(约一九三六年)
48 《墨井诗钞补》与《墨井画跋补》(一九三六年八月)
49 《廿二史刳记》批注及《廿二史刳记考正》稿(一九三六年至五十年代)
50 家书谈家世(一九三七年三月十四日)
51 致启功函谈吴渔山年谱资料(一九三七年四月二十七日)
52 《旧五代史辑本发覆》初稿(一九三七年八月)
53 致傅增湘函稿谈《旧唐书》补页(一九三七年十月)
54 《释氏疑年录》稿(一九三八年)
55 《汤若望与木陈志》资料(一九三八年)
56 履历表草稿(一九三九年十一月十六日)
57 《阅嘉兴藏记》(一九三九年九月至一九四〇年十一月)
58 《明季滇黔佛教考》稿(一九三九年十一月至一九四〇年五月)
59 《校雠略》课教材(一九四〇年三月)
60 《清初僧诤记》稿(一九四〇年十一月至一九四一年二月)
61 《南宋初河北新道教考》稿(一九四一年三月至八月)
62 《伟大之中华民族》一文提纲(一九四一年十二月八日)
63 《再跋于文襄论四库全书手札》稿(一九四二年二月)
64 《艺舟双楫与人海》讲稿(一九四二年六月十三日)
65 《陈香伯公教论书后》讲稿(一九四二年六月二十)
66 《中国佛教史籍概论》初稿(一九四二年八月)
67 《王西庄窥园图记跋》稿(一九四二年十二月)
……
99 《两封无名字无年月的信》稿(一九六五年十月)
说明
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