高通量测序与高性能计算理论和实践

图书标准信息

• 作者 陈禹保、黄劲松 编
• 出版社 北京科学技术出版社
• 出版时间 2017-05
• 版次 1
• ISBN 9787530484746
• 定价 186.00元
• 装帧 平装
• 开本 16开
• 纸张 胶版纸
• 页数 296页
• 字数 448千字
• 正文语种 简体中文

【内容简介】

　　《高通量测序与高性能计算理论和实践》为两大部分，即高通量测序实验篇和NGS数据分析篇。全书共四章，前两章为实验篇，包括第一章：测序技术进展，第二章：高通量测序实验。后两章为NGS数据分析篇，包括第三章：生物信息分析环境构建，第四章：高通量测序数据生物信息分析。

【目录】

1 测序技术进展
1．1 绪论
1．2 测序技术发展历程
1．2．1 发展中的DNA测序技术
1．2．2 经典的DNA测序方法
1．3 sanger测序技术的原理和流程
1．3．1 Sanger测序技术的原理
1．3．2 Sanger测序技术流程
1．3．3 影响DNA测序的因素
1．4 测序常见问题及分析
1．4．1 PCR产物测序套峰
1．4．2 测序没有信号
1．4．3 测序反应提前终止
1．5 sanger法测序的应用领域
1．5．1 DNA测序
1．5．2 功能强大的片段分析
1．5．3 SNP研究
1．6 第二代测序技术
1．6．1 第二代测序技术的特点
1．6．2 第二代测序技术原理
1．6．3 第二代测序技术的应用
1．6．4 第二代测序技术比较
1．6．5 第二代测序技术存在的问题
1．6．6 第二代测序技术发展及展望
1．7 第三代测序技术
1．7．1 Heliscope单分子测序
1．7．2 单分子实时测序技术
1．7．3 纳米孔单分子技术
1．7．4 第三代单分子测序技术的应用

2 高通量测序实验技术
2．1 de novo测序实验
2．1．1 de novo测序介绍
2．1．2 实验设计
2．1．3 基因组DNA的提取
2．1．4 文库构建
2．2 重测序实验
2．2．1 重测序介绍
2．2．2 重测序常用实验方法
2．2．3 实验设计
2．2．4 文库构建
2．2．5 重测序技术的应用
2．3 转录组测序实验
2．3．1 转录组与转录组学介绍
2．3．2 实验设计
2．3．3 文库构建
2．3．4 验证实验
2．4 宏基因组测序实验
2．4．1 宏基因组学背景介绍
2．4．2 方案设计
2．4．3 常见环境微生物样本制备及DNA提取方法
2．4．4 文库构建
2．4．5 宏基因技术的应用
2．5 microRNA测序实验
2．5．1 microRNA介绍．
2．5．2 实验设计
2．5．3 文库构建
2．5．4 体外实验功能验证
2．5．5 体内实验验证
2．6 lncRNA 测序实验
2．6．1 lncRNA介绍
2．6．2 lncRNA实验设计
2．6．3 rRNA去除
2．6．4 文库构建
2．6．5 lncRNA：PCR（多基因或单基因验证）
2．6．6 lncRNA的荧光原位杂交（FISH）
……
3 生物信息分析环境构建
4 高通量测序数据生物信息分析