华大基因国家基因库系列：生物信息数据库建设、使用与管理指南

图书标准信息

• 作者 张勇、严志祥、魏晓峰 编
• 出版社 科学出版社
• 出版时间 2014-10
• 版次 1
• ISBN 9787030418005
• 定价 150.00元
• 装帧 精装
• 开本 16开
• 纸张 胶版纸
• 页数 290页
• 字数 430千字
• 正文语种 简体中文
• 丛书 华大基因国家基因库系列

【内容简介】

　　《华大基因国家基因库系列：生物信息数据库建设、使用与管理指南》先从整体上对国内外生物信息数据库进行整体的概述。从数据来源、数据类型、生物数据分析方法、生物信息分析平台等方面探讨如何对生物数据库的数据进行管理，包括数据采集、数据存储、备份和恢复等。然后介绍了数据库设计的方法、原则及常见生物信息数据库的特点并以NCBI为例介绍了数据库如何提交数据、检索数据等。最后探讨了数据库的伦理学及知识产权保护问题。

【目录】

前言

第一篇 生物信息数据库概述

1 生物信息数据库

1.1 生物信息数据库概述

1.2 生物信息数据库的分类

2 国内外生物信息数据库的发展

2.1 国际生物信息数据库的发展

2.2 中国的生物信息数据库建设

2.3 建设生物信息数据库：存在的问题和解决思路探讨

第二篇 用于建立生物信息数据库的数据管理

3 数据来源

3.1 从各种生物信息数据库的FTP下载

3.2 各种生物信息数据库的查询结果

3.3 各实验终端提供的数据

4 数据类型

4.1 原始数据

4.2 生物信息分析数据

5 生物信息分析平台

5.1 生物信息分析平台简介

5.2 Galaxv平台

5.3 GenePattel—n生物分析平台

5.4 DNAnexus生物分析平台

5.5 Blast forneKP Project

6 数据质量管理规范

6.1 数据质量概述

6.2 生物数据的质量控制

7 数据存储管理

7.1 存储内容

7.2 大数据存储

7.3 存储方式

7.4 存储管理一般原则

8 数据备份和恢复管理规范

8.1 数据的备份

8.2 数据的恢复

9 数据安全管理规范

9.1 数据分类

9.2 权限管理

9.3 注意事项

第三篇 建立生物信息数据库的实用指南

10 概述

10.1 引言

10.2 数据相关的基本概念

11 数据库设计

11.1 数据库设计过程

11.2 数据库设计规范（以关系数据库为例）

11.3 数据库命名规范

12 常见生物信息数据库特点

12.1 数据模型

12.2 数据库的存储

13 生物信息数据库系统开发

13.1 虚拟本地数据库

13.2 本地数据库

第四篇 生物信息数据库的使用管理规范

14 数据库的安全性管理

14.1 安全性的类型

14.2 数据库安全性控制方法

14.3 基于角色访问控制的安全性和权限管理

15 数据提交管理

15.1 概述

15.2 提交内容

15.3 提交方式

16 数据共享和交互

17 数据检索

17.1 检索工具

17.2 检索结果格式j

第五篇 伦理学问题

18 国际伦理法则

19 生物大数据中的伦理问题

20 国内生物信息数据库中的伦理问题

21 伦理规范

21.1 伦理的原则

21.2 关于知情同意

22 伦理审查建设

22.1 公开透明的政策和社会广泛参与

22.2 信息的处理（保密和告知研究结果）应以参与者利益为重

22.3 建立有效的监督和责任机制

22.4 加强伦理审查能力建设

第六篇 生物信息数据库知识产权保护

23 引言

24 国内外数据库权利保护相关条约、协议

24.1 欧盟数据库法律保护

24.2 美国数据库法律保护

24.3 WIP0数据库法律保护

24.4 我国数据库法律保护现状

25 生物信息数据库的保护模式探讨

25.1 存在的问题

25.2 生物信息数据库知识产权保护建议

参考文献

缩略语表

名词术语