正版药物设计学
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北京丰台
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作者唐赟 著
出版社化学工业出版社
ISBN9787122359933
出版时间2020-04
版次1
装帧平装
开本16开
纸张胶版纸
页数361页
定价58元
货号2170-9787122359933
上书时间2024-12-23
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基本信息
书名:药物设计学
定价：58元
作者:唐赟 著
出版社：化学工业出版社
出版日期：2020-04-01
ISBN：9787122359933
字数：
页码：361
版次：
装帧：平装
开本：16开
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内容提要
《药物设计学》全书共四篇：导论篇、基础篇、方法篇、应用篇。其中导论篇（章）总体介绍药物、药物发现、药物设计等基本概念，以及药物设计的发展历程、主要特性；基础篇（第2～5章）主要介绍药物设计学的分子基础、理论基础、信息学基础以及传统药物设计知识；方法篇（第6～9章）主要介绍药物靶标识别和预测方法、计算机辅助先导化合物发现方法、计算机辅助先导化合物优化方法、临床前研究中的药代动力学性质与毒性预测方法；应用篇（0章）则为读者选取了几个成功的药物设计实例。本书从基本概念入手，兼顾基础知识、基本技能和应用实例，整体内容深入浅出，写作语言浅显易懂，章节体系与其它同名教材有较大不同，在传统药物设计的基础上，重点突出计算机辅助药物设计。《药物设计学》可作为全国高等医药院校药学专业及相关专业的本科生、研究生教材，也可供从事新药研究和开发的科研人员参考。
目录
绪论10．1药物设计学的形成与发展10．2学习药物设计学的意义20．3本书内容简介3思考题4参考文献4第一篇导论篇章药物设计概述61．1什么是药物？61．1．1药物的基本概念61．1．2药物的主要属性81．1．3药物的主要来源81．1．4药物发现的历史回顾91．2什么是药物设计？101．2．1药物设计的基本概念101．2．2药物设计的主要特性121．2．3药物设计的起源131．2．4药物设计的发展历程161．3一个经典的药物设计实例181．3．1靶标确定181．3．2先导化合物发现191．3．3靶标结构模型设想201．3．4先导化合物结构优化211．3．5卡托普利诞生的意义221．4药物设计所需的知识、技能和条件23本章小结24思考题25参考文献25拓展阅读26第二篇基础篇第2章药物设计的分子基础282．1概述282．2药物分子结构特征292．2．1手性302．2．2类药性322．2．3药物分子结构解析332．2．4配体效率352．3靶标分子结构特征362．3．1蛋白质372．3．2糖462．3．3核酸472．4药物-靶标相互作用原理502．4．1药物作用的分子药理学基础502．4．2药物-靶标相互作用模式502．4．3药物-靶标相互作用类型51本章小结52思考题52参考文献52拓展阅读53第3章药物设计的理论基础543．1概述543．2分子模拟基本知识553．2．1几个常用名称563．2．2分子文件格式573．3量子力学603．3．1量子力学的起源603．3．2量子力学基本理论623．3．3量子力学计算方法643．3．4量子化学在药物研究中的应用663．4分子力学703．4．1分子力学力场703．4．2常用的分子力场723．4．3分子力学与量子力学比较743．5分子动力学753．5．1分子动力学基本原理763．5．2常用分子动力学方法763．5．3分子动力学模拟的应用773．6结合自由能计算803．6．1自由能微扰和热力学积分方法813．6．2基于经验方程的结合自由能计算方法833．6．3基于分子动力学采样的自由能预测方法85本章小结88思考题88参考文献89拓展阅读90第4章药物设计的信息学基础914．1概述914．2信息学基础知识934．2．1数据库基础934．2．2统计学基础954．3信息处理的基本方法974．3．1信息处理的一般流程974．3．2学习策略984．3．3统计分析方法994．3．4机器学习方法1004．3．5神经网络与深度学习1044．3．6模型评价1074．3．7模型构建工具1094．4化学信息处理1114．4．1化学分子结构表达1124．4．2分子结构的数学描述1154．4．3分子相似性计算1184．4．4预测模型构建1194．4．5虚拟化合物库设计1214．5生物信息处理1234．5．1序列分析1244．5．2蛋白质结构预测1254．5．3同源模建1274．5．4序列比对和结构预测的在线资源和工具128本章小结129思考题129参考文献130拓展阅读131第5章传统药物设计方法1325．1概述1325．2先导化合物的发现1335．2．1基于天然产物活性成分发现先导化合物1335．2．2基于内源性生物活性物质发现先导化合物1345．2．3基于药物的副作用发现先导化合物1355．2．4基于药物的代谢作用发现先导化合物1365．2．5化合物库筛选发现先导化合物1365．2．6其它途径1375．3先导化合物优化原则1375．4生物电子等排原理1385．4．1“生物电子等排体”的由来1385．4．2生物电子等排体的类型1395．4．3生物电子等排原理的应用1405．5前药原理1425．5．1前药的定义及基本特征1425．5．2前药设计时需要考虑的问题1435．5．3前药原理的应用1445．6拼合原理1465．7其它先导化合物优化方法147本章小结149思考题149参考文献149拓展阅读150第三篇方法篇第6章药物靶标识别与预测1526．1概述1526．2靶标识别与确证1536．3网络药理学与靶标预测1546．4基于结构的靶标预测1576．4．1反向分子对接1586．4．2反向药效团匹配1596．5基于配体的靶标预测1606．5．1相似性搜索1606．5．2机器学习1626．6基于网络的靶标预测1646．6．1基于网络推理方法1646．6．2药物子结构驱动的网络推理算法1686．6．3基于随机游走方法1706．6．4基于基因表达谱方法1716．7靶标预测方法的应用1726．7．1药物重定位1736．7．2活性化合物的潜在靶标预测1776．8靶标预测的在线资源和工具180本章小结182思考题183参考文献183拓展阅读186第7章计算机辅助先导化合物发现1877．1合理药物设计概述1877．2分子对接1897．2．1分子对接基本概念1897．2．2分子对接的一般流程1907．2．3配体构象搜索方法1917．2．4受体柔性处理方法1937．2．5打分函数1947．2．6分子对接工具1977．2．7分子对接的应用1987．3药效团模建1997．3．1药效团基本概念1997．3．2药效团特征1997．3．3药效团模型的构建2017．3．4药效团模型的应用2027．4虚拟筛选2037．4．1虚拟筛选概念2037．4．2基于结构的虚拟筛选2047．4．3基于配体的虚拟筛选2067．4．4虚拟筛选的应用2107．5全新药物设计2117．5．1全新设计的基本概念2117．5．2全新设计的一般流程2127．5．3全新药物设计的应用2167．6应用实例2177．6．1研究背景2177．6．2基于结构虚拟筛选发现ERβ选择性配体2187．6．3基于活性化合物的相似性搜索2217．6．4ER配体药效团模型构建2227．6．5采用组合虚拟筛选策略发现新型选择性ERβ配体2237．6．6研究小结227本章小结227思考题228参考文献228拓展阅读230第8章计算机辅助先导化合物优化2318．1概述2318．2经典QSAR方法2328．2．1QSAR基本概念2328．2．2QSAR发展简史2338．2．3QSAR的三个支柱2358．2．4QSAR模型构建步骤2398．2．5QSAR建模的注意事项2408．2．6QSAR应用2418．2．7相关软件和网络资源2428．33D-QSAR方法2428．3．1CoMFA方法2438．3．2CoMSIA方法2448．3．3基于靶标结构的3D-QSAR方法2458．3．43D-QSAR应用实例2458．4基于结构的先导化合物优化2528．4．1分子模拟技术的应用2528．4．2基团变换策略2538．4．3合环开环策略2558．4．4邻位修饰策略2578．4．5肽键变换策略2588．5骨架跃迁2598．5．1骨架的定义2598．5．2骨架跃迁的起源和发展2598．5．3骨架相似性的量度2618．5．4骨架跃迁的方法分类2618．5．5骨架跃迁的应用2668．6基于性质的先导化合物优化2668．6．1分子骨架库构建2668．6．2骨架指纹的定义2688．6．3骨架跃迁的程序实现2698．6．4ADMET性质优化案例271本章小结273思考题274参考文献274拓展阅读276第9章药代动力学性质与毒性预测2779．1概述2779．2药物的体内过程2789．3ADMET预测的一般流程2809．4药物理化性质预测2819．4．1脂溶性2829．4．2水溶性2839．4．3pKa值2859．5药代动力学性质预测2879．5．1吸收2879．5．2分布2919．5．3代谢2989．6药物毒性预测3069．6．1药物毒理学简介3069．6．2计算毒理学的出现和发展3079．6．3毒性预测模型3089．6．4警示子结构识别3149．7相关软件和网络资源317本章小结320思考题320参考文献320拓展阅读325第四篇应用篇0章药物设计应用实例32810．1概述32810．1．1基于配体药物设计的成功实例32910．1．2基于结构药物设计的成功实例33010．2靶向神经氨酸酶的抗流感病毒药物设计33210．2．1酶抑制剂设计概述33210．2．2流感与神经氨酸酶33210．2．3扎那米韦的设计33410．2．4奥司他韦的设计33510．2．5案例启示33610．3靶向μ受体的新型镇痛药物设计33710．3．1GPCR配体设计33710．3．2镇痛药与受体33810．3．3新型镇痛药的设计过程33910．3．4案例启示34110．4靶向MDM2-p53相互作用界面的抗肿瘤药物设计34110．4．1蛋白-蛋白相互作用34110．4．2肿瘤与MDM2-p53相互作用34210．4．3MDM2抑制剂的发现历程34410．4．4案例启示34610．5靶向雄受体-DNA相互作用界面的抗肿瘤药物设计34610．5．1蛋白质-DNA相互作用34610．5．2雄受体与前列腺癌34610．5．3虚拟筛选获得苗头化合物34710．5．4CADD辅助先导化合物优化34810．5．5案例启示348本章小结349思考题349参考文献349拓展阅读351中文索引/ 352英文索引/ 357
作者介绍
唐赟，华东理工大学，教授、博士生导师，长期从事本科教学工作，自2006年开始，一直负责主讲药学本科专业核心课程“药物设计学”（32学时），该课程2007年入选华东理工大学精品课程，2010年入选上海市重点课程。同时自2006年开始一直主讲研究生专业课程“计算机辅助药物设计”（32学时）。已发表教学研究论文10篇，主编教材1本、参编2本。2009年获得上海市育才奖，2010年获得宝钢教师奖，2012年获得校教育教学成果奖一等奖、二等奖各1项，2013年获得上海市教学成果一等奖（第四完成人），2015年获得“天鼎-东岳”奖教金特等奖，2016年获得校教书育人奖。 科研方面：作者自1991年开始，近三十年来一直从事计算机辅助药物设计研究，承担着国家自然科学基金、国家重点研发专项、863计划、新药创制科技重大专项等科研项目10余项，已在J. Med. Chem., Bioinformatics, Briefings iBioinformatics, PLoS Comput. Biol., J. Chem. Inf. Model.等国内外专业期刊发表SCI收录论文近200篇，申请中国发明专利10项（其中授权4项），获得计算机软件著作权4项。2005年入选上海市首批“浦江人才计划”，2008年入选教育部“新世纪人才支持计划”。兼任上海市学位委员会学科评议组成员（药学学科），上海市药学会药物化学专业委员会委员，中国化学会计算机化学专业委员会委员，中国毒理学会计算毒理专业委员会委员，上海市新药设计重点实验室学术委员会委员，《华东理工大学学报（自然科学版）》编委，美国化学会期刊J. Chem. Inf. Model.顾问编委。主译学术专著《药物分子设计－从入门到精通》（当代化学译丛，华东理工大学出版社，2012年3月出版），参译学术专著《实用药物化学》（科学出版社，2012年4月出版）、《创新药物发现 - 实践、过程和展望》（华东理工大学出版社，2016年5月出版）。
序言
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